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另一个是监检司，负责对浙江的各级官员进行监督检查其贪污、受贿、渎职、作风等行为，也就相当于后世的纪检委或廉政公署。
随着商家军在浙江的统治稳定下来，商毅手下各官员的权力也都会随之扩大，而权力的扩大，必然就自造成各种营私舞弊的现像发生，在权力的面前，绝不能把希望寄托在每个人的自律上必须要有一个有效的监查机构，来监督检查官员们的行为和工作。毕竟每一个贪官都是从小贪开始，逐步走向大贪的。
商毅不怀疑目前自己手下的官员对自己的忠诚度，但忠诚不等于廉洁和奉公，想依靠他们的忠诚度来保持自律是痴心妄想。因为人都有自私性，如果能够利用手里职权为自己谋取一些利益，相信绝大多数人都很难抵挡得住这种诱惑。更不要相信体制的受益者就会例外，因为每一个贪官污吏其实都体制的受益者，都会拥护给予自己权力的体制，但这并不妨碍他们会以损害体制的利益来填满他自己的腰包。哪怕这样做会最终毁灭这个体制。
以前商家军的规模小，而且从一开始，商毅建立了完善的财务制度，又有审计机构，因此到现在为止，商家军内部没有发生大的营私舞弊事件，但小贪小污依然时有发生，己经处理了五六起。当然这种小打小敲的事情，也是不可能完全避免，只能发现一起，处理一起。但规模扩大以后，仅靠审计司也不够，何况审计司也只能管得住财务，管不用职权，因此设立一个监查机构，也是完全有必要的。
监查司将由商毅直接管理，主事是郝君侠。他原来是北京的户部主事，非常忠于职守，尽职尽责，虽然在商家军中的资励不够，但从另一个方面看，和任何一方也没有什么深交，在相当程度上也保证他的公证性，因此出任监查司的主事非常合适。从权力上说，监查司拥有调查权、问责权、临时拘捕权，但没有审判权。当然监查制度还要在试行中慢慢完善。
两个新设的大机构就这样确定下来，最后，在农业司下面，商毅又设立了土地局和粮食局这两个次一级的部门。
在掌握了浙江的权力之后，商毅对内的下一步计划就是清丈土地，查实田产，一方面是使每一户都有自己的土地，稳定社会局面，也为以后安置难民做准备，另一方面也是做为以后税收的依据，多田产者多交，少田产者少交，保障税收的公平性。因此也需要成立一个专门的部门来管理这方面的工作。
而粮食是战略物资，自从到了浙江以后，商毅就一直在储备粮食，现在储备的各种粮食己经超过了七十万石，不仅如此，商毅还打算把整个浙江的粮食都实行计划控制，以便在战时进行统一的安排和分配，因此也需要一个专门的部门来管理。
行政机构上的调整暂时只有这些，而接下来，就是对军队机构进行调整了。
在军队中，商毅也设立了三个新的组织，宪兵队、情报处、安全处。
商家军成立至今，除了取得赫赫战功之外，另一个值得称道的地方就是军纪严明、秋毫无犯。但商毅也知道，随着军队的扩大和组成复杂，在军队内部，也同样需要一个监查机构，来管理监督军队的违纪行为。宪兵队就是这样一个机构。
宪兵队是由最早加入商家军，又没有犯过错误的老兵组成，属于那种思想觉悟很高，而且对商家军的名声和荣誊都非常重视的人。任务就是处理商家军的士兵以及预备兵、达标兵的违纪行为，当然还有冒充商家军的流氓无欶。宪兵队拥有抓捕、审问、处罚的权力。同时商毅在规定，任何士兵都不得与宪兵队发生冲突，必须服从宪兵队执行任务，否则都按违纪处理。
情报处的作用就是刺探敌人内部的信息、秘密等，除商家军以外，其他任何势力都将是情报处工作的对像，目前商家军己经开北京、南京都建立起情报网络，以后还要逐渐扩大到所有大型城市中去。情报处的负责人是吴汉生。
安全处的功能正好和情报处相反，他是对内的机构，就是保证商家军内部的安全，甄别和抓捕敌方的情报人员，阻止敌方人员在商家军控制区内的破坏活动。
现代人对这两个机构都不陌生，就趸特工组织，在后世的许多国家，这两个机构实际都合二为一了。如美国中央情报局、俄罗斯的克格勃，当然还有著名的007。而这个时代令人闻风变色的锦衣卫，也属于这类机构。只不过锦衣卫的名声太坏了，商毅也不打算使用，还是自己另起炉灶，陪养属于自已的特工人员。
商毅在穿越之前，虽然只是特种兵，不是特工，但有许多任务，特种兵都要和特工密切配合，也和特工一起进行过多次交流和反恐演习，并且也一同执行过几次任务，因此商毅对特工的训练方法和工作方式也有相当的了解，因此也定下几条用人标准，让周琦和吴汉生马上去招募一些人员来。
第038章 军队调整
目前商家军己经发展到了师一级的编制，一个标准师下管辖着三个团。商家军的第一师和第二师都己经树旗成立，一个留守在浙江，另一个驻守在登州。
因为在以后师将成为商家军的主要作战单位，因此必须对每个师的兵力结成，做一些调整，使其配置更为合珵，充份的发挥战斗力。商毅也作出决定，将每个每的三个团分为两个主战团和一个辅助团。
主战团将全由火枪兵组成，并将逐步淘态火绳枪，全部都使用燧发枪，同时每个团还配备六十门中小型野战火炮，中型和小型火炮的比例为一比二，每个营十五门，以加强作战火力。
而辅助团里又分两个后勤营，和二个火炮营，每一个后勤营将配有三百辆车，三百匹马驴，不仅责任运送全军的粮食，还要保障充足的弹药供应。而火炮营将配备四十到六十门火炮不等，将以中型火炮为主，并辅以少量的重型火炮，中型火炮和重型火炮的比例也三比一，另外还配三十到五十架管风琴枪车，在战斗中为主战团提供火力支持，在暂时不给辅助团配置火枪，但等以后军工发展了，辅助团也将都配上火枪，因此还兼有预备队的作用。
每个师的兵力配置就是这样，至于其他侦察兵、骑兵，在一般情况下，都不配备，而是在战前，从其他队伍中抽调搭配。同时商毅还发送一份配置标准到登州，让二师的师长周少桓，也按照这个标准，来组建第二师。
接着商毅又下令，命六团去替换守卫苏州的第五团，把五团调回杭州，并以四团、五团这两个团为核心，组建商家军的第三师和第四师。力争在今年内，浙江地区的三个师都将整编齐全。
因为这次北京之行还得到了不少马匹，因此商毅也决定，从中选出一批充当战马，将骑兵团扩大升级为骑兵旅，仍然由杨武丞担任旅长。而侦察兵团不变，原来的两名团长，周琦和吴汉生各有新的安排了，因此侦察团的团长就由段鹏担任，商毅的卫队另选其他人。
同时商毅也对军队的制服也进行重新设计，步军的军服还是墨绿色，而骑军为红色，海军为深蓝色。
在士兵的装配上，一个标准步兵的武器是一支带刺刀的火枪，两到四颗拉弦式手榴弹和六十发定装子弹，手榴弹和子弹都用一个防水的牛皮包装好。
而骑军分为轻骑兵和重骑兵两种，不过商家军的重骑兵和传统的重骑兵慨念不同，所穿的盔甲和轻骑兵差不多，只是胸甲略厚一些，战马也只是在头部，颈部，正面装上铁甲，实际上重骑兵同样据有很强的机动性和速度。而轻骑兵和重骑兵的武器配置，都有一支带护手盘的长矛，一把马刀，一柄单刀。另外轻骑兵还会配五把短柄飞斧。而下一步，商毅还打算给骑兵配上短管火枪。
只有海军的装配最简单，海军分为士兵和水手两类，水手付责操作战船以及火炮，因此都不配盔甲和火枪，所用的武器也只是短刀或水手斧，而士兵则付责海战中的接舷战，或者是登陆作战，也和步军一样，装配护甲和火枪，但一般情况下不配手榴弹。
而这一次军队的重点调整是在海军，商家军的海军成立己有大半年时间，既使不算西班牙雇佣海军，总人数己达到五千五百多人，其中基地成员为一千二百多人。目前己经拥有各种船只一百八十余艘，包括西式战船有五十二艘。论规模己不算小了，但因为海军一直都处于草创和训练阶段，因此暂时还对海军进行分类整编，各艘战船也没有命名。而现在海军虽然还没有进行过一次战斗，但也出航参加过几次任务，也应该正式整编。
商毅首先把海军的船只进行分类，大致分为主力战船、铺助战船、运输船、哨船四个大类。所有的西式战战船全都划归为主力战船；铺助战船包括有两艘一千料福船，六艘六百料福船和六艘四百料福船、二十二艘苍山船、十八艘艟矫船；运输船有五十五艘，全是褔船；哨船有十八条，包括十二艘开浪船和八艘飞剪船。
同时又把主力战船分为五个等级，两千五百料以上为一级；两千料至两千五百料为二级，一千五百料至两千料为三级，一千料至一千五百料为四级；一千料以下为五级。一级和二级都称为战列舰，三级称为巡洋舰，四级称为驱逐舰，五级称为护卫舰。这个分类也是大体参考稍后一些时间，英国对战舰分类的标准。每艘船设船长一名，大副一名，其余职位根据各船的大小不等，各自不同。
战船的名称，商毅决定一级战列舰以中国古代名将的名字来命名，二级战列舰，以中国神话中的神兽命名，而现在商家军的一级战列舰还没有，二级战列舰也只有“银河”号一艘，也就不改名了，等以前造出了新的战列舰，再按这个标准命名。
三级巡洋舰也是以后重点发展的类型，以后也会是数量最多的一种战舰，因此就以天罡地煞星来命名，不过现在商家军只有六艘巡洋舰，分别命名为：天魁号、天罡号、天机号、天闲号、天勇号、天雄号。
四级驱逐舰目前有二十八艘，正好就用二十八星宿的名字来命名，五级护卫舰有十八艘，则全部用浙江地区的地名来命名。其他辅助战船都是褔船，因此也以“福”字号来命名。
不过目前商家军的海军的主力战船虽然不算少，但从结成上来说，目前商家军的搭配并不合理，中小型主力战舰偏多，而大中型战舰偏少，合理的战舰搭配应是以第三级巡洋舰为主，然后向两头逐次减少，因此在以后要逐渐改善这个结构。
然后商毅又将目前的海军分为五个分舰队，每个分舰队只有主力战船和铺助战船，数量在二十艘到二十五艘不等，设旗舰一艘、第二旗舰一艘，旗舰舰长同时也兼任分舰队舰长。而运输船和哨船则根据战场的需求，临时分派给各支分舰队。
因为在这个时候的海战通迅不便，无论是多么训练有训的海军，靠一艘旗舰根本不可能指挥得了百艘以上的战船，因此将一支船队分散为若干支二十艘左右的分舰队，实行层层指挥，才是最好的办法。
另外商毅还得到