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虽然克塞诺芬尼的宇宙论站不住脚，但其自然论却引人注目：它摆脱了泛灵论以及半宗教因素，而此类因素在一些前苏格拉底哲学家那里均可找到。譬如，彩虹既非一种神祇（譬如希腊众神中的彩虹女神），也非一种神圣标记（譬如诺亚所看到的那种标记），而只不过是一条多彩的云（KRS178）。这种自然论并不意味着克塞诺芬尼对宗教没有兴趣。恰恰相反，他的神学意识在所有前苏格拉底思想家中最为突出。不过，他鄙视流行的迷信，推举一种朴素而老道的一神论（monotheism）。但是，他在神学与物理学方面并不教条。如他所言：
时间初始，神并未告知我们人类一切
只有通过长期探索，知识才会光顾人类。
（KRS188）
正文 赫拉克利特（1）
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赫拉克利特
在早期伊奥尼亚哲学家中，赫拉克利特（Heraclitus）是最后一位最著名的哲学家。他比克塞诺芬尼大约年轻30岁，据说他在公元前6世纪末正值中年（D。L9。1）。他生活在爱菲斯（Ephesus）这座大城邦，位于米利都和科罗封两个城邦之间。与在他之前的任何一位哲学家相比，我们对赫拉克利特的著作材料掌握较多，但这并不意味着我们会觉得他的思想比较容易理解。他所遗残篇采用了简洁有力、机智巧妙的散文警句形式，读来经常使人感到晦涩难懂，有时令人觉得他有意写得模棱两可。赫拉克利特不加论证，只是断言。他那种特尔斐式的隐晦文体，或许效仿了阿波罗的神谕，用他的话说，这种神谕“既不言说，也不隐瞒，只是示意”（KRS244）。后来几个世纪的许多哲学家，都很敬佩赫拉克利特，有幸为他的那些充满悖论的、如同变色蜥蜴似的言论增光添彩。
即便在古代，赫拉克利特的思想也是难以理解的。他的绰号包括“神秘莫测者”与“晦涩难懂的赫拉克利特”（D。L9。6）。他撰写过一部三卷本的哲学论著（现已遗失），将其存放在阿特密斯女神（相当于圣保罗的“爱菲斯人的狄安娜”这位月亮和狩猎女神）的大庙里面。人们难以确定那是一部物理学还是政治学论著。据说，苏格拉底对这部论著这样讲过，“我所理解的东西是精彩的，我不理解的东西可能也是精彩的；只有深海潜水采珠者才会抵达海底”（D。L222）。19世纪的德国观念论哲学家黑格尔，对赫拉克利特十分敬佩，他用潜海的隐喻表达了相反的判断。他曾这样写道：经历过起伏不定的早期前苏格拉底哲学家的思辨活动之后，我们抵达赫拉克利特的思想领地，我们以为终于可以看到陆地了。黑格尔继而自豪地说道：“在我的逻辑学中，没有赫拉克利特的命题是我未曾采纳的。”
如同后来的笛卡尔和康德一样，赫拉克利特意识到自己是在开启一个全新的哲学。他认为先前思想家的研究成果毫无价值：荷马（Homer）在诗歌竞赛的初期阶段就应该被除名，赫西俄德（Hesiod）、毕达哥拉斯以及克塞诺芬尼只不过是没有真知灼见的博学之士而已（D。L91）。不过，也像笛卡尔和康德一样，赫拉克利特受到前辈哲学家的影响大于他自己所意识到的程度。他就像克塞诺芬尼那样，对流行宗教提出严厉批评，认为以血腥的祭品来洗刷血腥的罪过，犹如以泥污来洗刷泥污。面向神像祈祷，如同在空房子里窃窃私语；生殖器崇拜礼仪与酒神崇拜仪式，委实令人恶心（KRS241；243）。
正文 赫拉克利特（2）
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赫拉克利特也与克塞诺芬尼一样，相信太阳每日都是新的（亚里士多德，Mete22355b13…14）。与此同时，他也像阿那克西曼德一样，认为太阳受到宇宙修复原理的限制（KRS226）。在赫拉克利特那里，短命的太阳学说的确被扩展为一种万物流变说（doctrineofuniversalflux）。他声称，万物流变，无物常驻；世界如同一条水流。如果我们两次涉入同一条河流，我们不可能两次都将自己的双脚踩入同样的水流，因为水流在转瞬之间已非原来的水流（KRS214）。情况看来的确如此，但在表面上赫拉克利特却走得过远，竟然声称我们不可能两次涉入同一条河流（柏拉图；Cra402a）。若从字面意义上看，这一说法是错误的，除非我们采用同一准则，将河流理解为蓄水槽而非流水道。若从比喻的意义上看，这一说法似乎认为世界万物是由不断变化的因素构成的。亚里士多德指出，假如这就是所要表达的意思，那么所有变化都是感知不到的东西（Ph8。3。253b9ff。）。或许这是赫拉克利特的警句所暗示的意思，他认为隐性的和谐好于显性的和谐——和谐是流动宇宙的基本节奏（KRS207）。无论赫拉克利特的所言意味着什么，他在后来的希腊哲学中有着长期的历史影响。
比一条水流更为突出的一阵大火，是不断变化的一种范型，只要添加燃料，就会燃烧不止。赫拉克利特曾经说过，世界就像永恒的活火：海洋与土地就是这永燃之火的灰烬。火似金：你可用金子交换各种货物，火可以转化为这些元素中的任何一种（KRS217…219）。这个像火一样燃烧的世界是现有的唯一世界，这个世界不是由神祇或人类创造，而是完全由逻各斯主导。他争论说，将这个辉煌的宇宙当做一堆垃圾是荒诞不经的想法（DK22B124）。“逻各斯”（Logos）是希腊日常用语，表示写作或言说的词语，但从赫拉克利特开始，几乎每位希腊哲学家都会赋予其一层或几层重要含义。翻译家经常将其释为“理性”（Reason），抑或是指人类个体的理性思考能力，抑或表示某种更高的宇宙秩序与美的原理。当《约翰福音》的作者宣称：“太初有逻各斯，逻各斯与上帝同在，逻各斯就是上帝”（John1：1），从而使逻各斯这一术语进入基督教的神学领域。
赫拉克利特指出，普遍的逻各斯难以把握，大多数人都无功而返。若与那位在逻各斯面前觉醒的人相比，其他人就像龟缩在梦幻世界的睡眠者一样，他们不会直面独一无二的普遍真理（S。E。；M7。132）。人类因其与主导宇宙的理性之火距离不等而分为三等。像赫拉克利特这样的哲学家，距离像火一样的逻各斯最近，从中收到的温暖最多；其次，觉醒的普通人利用他们的理性思考能力，从中取得光；最后，睡不醒的人使自己的灵魂之窗堵塞，只能通过呼吸与自然保持接触（S。E。；M7129…130）。逻各斯就是神吗？赫拉克利特给出这样一个非常含糊其辞的回答：“唯有一种真正明智的东西，既乐意也不乐意以宙斯的名义称谓。”他的大概意思是说，逻各斯是神圣的，但不等同于奥林帕斯诸神中的任何一位。
正文 赫拉克利特（3）
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人的灵魂本身是火：赫拉克利特有时将灵魂与土和水三元素列在一起。因为水可灭火，最佳的灵魂是干燥的灵魂，因此必须与潮湿隔离。很难知道潮湿或湿度在此语境中的确切用意，但酒精确能说明问题：赫拉克利特曾说，酒醉者是一位由小孩引导的男人（KRS229…231）。不过，赫拉克利特所用“潮湿”一词的含义，近似于下列现代谚语的含义：譬如，战死疆场的勇敢坚强之士，都有一颗干燥的灵魂，宁可加入宇宙之火，也不愿忍受水中死亡（KRS237）。
黑格尔最敬佩赫拉克利特的地方，是其坚持对立的统一＇原理＇，譬如，宇宙既可分又不可分，既化育又不化育，既短暂又不朽，等等。这些对立统一现象的表述，有时直截了当，使用的是一些具有相对性的谓词。其中最著名的说法是：“向上与向下的路是同一回事”。这句话听起来非常深奥。不管怎么讲，这句话的意思是说：我连蹦带跳地下山时，碰到你正在费力上山，我们两人都走在同一条道上。不同的事物在不同的时候是吸引人的，你饥饿时食品对你有吸引力，你困倦时床铺对你有吸引力（KRS201）。不同的事物吸引不同的种类：海水对鱼类而言是有益的，对人类而言是有害的；驴子更喜欢垃圾，而不是黄金（KRS199）。
赫拉克利特所罗列的每一组对立统一问题，并非都能借助相对性轻易地予以解决，甚至连那些看来最无害处的对立统一问题，也可能包含着深刻的意味。为此，第欧根尼·拉尔修（DiogenesLaertius）告知我们，火—气—水—土这一系列代表向下的路径，土—水—气—火这一系列代表向上的路径（D。L99…11）。如果将这两条路径视为持续、永久的宇宙进步的两个阶段，那么就只能将其视为同一条路径。赫拉克利特的确相信，宇宙之火经历了几个燃起与熄灭阶段（KRS217）。也许是在这一意义上，我们会理解宇宙既化育又不化育、既短暂又不朽这类特性（DK22B50）。这一基本过程无始无终，但是，每一个燃起与熄灭的循环过程，便是每个世界得以生灭的起因。
虽然一些前苏格拉底哲学家据说在政治上一直活跃，但根据赫拉克利特的残篇来看，可以说他是创立政治哲学的第一人。他对实际政治的确不感兴趣，作为一个可以继承王位的贵族，他舍弃了这一权利，将自己的财富转让给弟弟。据说，他曾这样讲过：他更喜欢与儿童一起游戏，也不愿意与政客为伍。不过，他是谈论神圣法的首位哲学家，这种法不是自然的法则，而是规定法，超越了所有人类法。
正文 赫拉克利特（4）
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波尔特（RobertBolt）有一部剧作名为《福难与共之士》（AManforAllSeason），所描写的主人翁是莫尔（ThomasMore），其中有一段十分著名。莫尔的女婿罗坡尔（Roper）催促他抓捕一名间谍，这件事与法律相违。莫尔拒绝执行，就此说道：“我知道什么是合法的，但不知道什么是正确的；我将恪守合法之事。”在回应罗坡尔的问题时，莫尔否认他将人法置于神法之上。他说，“我不是神，但在错综复杂的法律丛林中，我是一位林务官。”罗坡尔反唇相讥，声言自己不惜砍倒英格兰的所有法律丛林，也要追查到底、抓住魔鬼。莫尔回答说，“最后一部法律被砍倒时，魔鬼就会向你扑来——罗坡尔，所有法律平躺在地，你将于何处藏身？”
在莫尔的著作和录音中，难以找到有关这种思想交流的章节与韵文。但在赫拉克利特的残篇中，有两段表达了参与者的情操。“人们务必代表法律而战，亦如他们为了保护城邦城墙而战一样”（KRS249）。尽管城邦依靠自己的法律�