接着又组织敢死队发动第二次、第三次总攻击，使用兵力总计13万人，费时155天，最终以死伤6万人的代价攻下要塞。港内的俄国军舰因出路被堵，在海陆两面夹攻之下全军覆没。值得一提的是，乃本希典在1912年明治天皇死时，与其妻子在家里剖腹自尽，自愿为明治天皇殉葬，成为军国主义的殉葬品。
当高野五十六以少尉候补生资格登舰的时候，俄国在旅顺口、海参崴的太平洋舰队已基本上被消灭净尽，但战争并没有结束，一场规模更大、程度更烈的日本海大海战正等待着他。
高野五十六毕业前被编入战舰〃初濑〃号，但他尚未上舰，〃初濑〃号即在旅顺港触雷沉没。后来他被分配在〃春日〃号，继而1905年1月又改派到〃日进〃号。〃春日〃和〃日进〃是两艘装甲巡洋舰，原是阿根廷向意大利订购的，排水量为7700吨，经日本与阿根廷交涉，转卖给日本。当时日俄战争一触即发，1903年底刚刚完工的这两艘战舰，来不及完成舰内的设备安装，便于1904年1月9日驶离意大利。当2月6日到达日本横须贺时，其内部设施也在航行途中装备完毕，并马上投入战斗，被编入东乡平八郎直接指挥的第1舰队。年仅20岁的高野五十六在分到〃日进〃号后，给其父母寄了一张照片，在照片的背后写着：〃生死有命不足论，唯有鞠躬报至尊〃，表达了这个长冈武士后代临战前的心情。五十六后来在回忆此事时写道：〃当我经过3年苦学上舰时，日军攻陷了旅顺，敌人的第1太平洋舰队业已全军覆灭。正在为逢不到敌手而扼腕叹息的时候，传来敌人的主力舰队波罗的海舰队要来的消息，岂能不叫快哉。〃
此时，俄国的波罗的海舰队（改称第2太平洋舰队）正缓慢地从遥远的欧洲向远东跋涉而来。1905年5月14日，沙俄海军当局命令正在航行途中的波罗的海舰队开赴海参崴从当时的情况来看，要到达海参崴有3条路线可供选择：一是穿过对马海峡；二是穿过日本本州岛和北海道之间的津轻海峡；三是穿过北海道与库页岛之间的宗谷海峡。穿过对马海峡路程最近，但风险也最大。几经考虑，波罗的海舰队司令罗日杰斯特文斯基海军中将最后还是决定走对马海峡。为了迷惑日本海军，俄军派出两艘伪装巡洋舰，到日本东海岸近海一带，装出要走津轻海峡的样子。
日本联合舰队此时对选择在哪条路线上截击俄军同样大费脑筋。俄国舰队有战列舰8艘、装甲巡洋舰5艘、防护巡洋舰3艘、巡洋舰4艘，包括其他舰艇共38艘，如果让它进入海参崴，日本前一阶段的战果有可能完全化为泡影，因此聚歼俄国波罗的海舰队便成为日俄战争最为关键的一役。按编队平均航速10节①计算，俄国舰队应在5月20日到达对马海峡，但到了20日后并无消息。日本联合舰队十分担心俄舰队取道津轻海峡，正准备北上至津轻海峡堵截时，26日接到了6艘俄国运输船开到上海的情报，从而证实俄国舰队将要通过对马海峡。
①1节等于1海里/时。——作者
27日4时45分，〃发现敌舰队！〃日本联合舰队司令部终于收到了侦察船〃信浓丸〃发回的电报。随后不久又接到了〃敌舰队航向东水道的报告〃。联合舰队司令东乡平八郎见时机成熟，立即下令所有军舰出击，同时向大本营发报：〃接获发现敌舰队之报告，联合舰队立即出击，欲将其击灭。本日天气晴朗，但浪甚大。〃第1、第2舰队随即自镇海湾进入日本海，准备在对马海峡迎击俄国波罗的海舰队。
高野五十六所在的〃日进〃号是第卫战队司令三须宗大郎中将的旗舰，五十六任舰长的传令兵。上午10点，舰长召集全体人员作最后动员：〃我们久已等待的敌舰队即将来到，以国运相赌与之进行的大决战，3小时后即见分晓。我们无所顾忌，因为我们既有料敌如神的东乡大将，又有在旅顺方面参加过大大小小许多海战的勇士，况且我们在这以前日夜在镇海湾进行炮击、水雷发射训练，今日实在是显露我们精妙技术的时候，如果对战胜巴尔迪克舰队还有什么要求的话，那就是要沉着冷静。仰望祖国无所畏惧。谨让我们高呼天皇陛下万岁。〃全舰士兵三呼天皇万岁，作好了为天皇献身的准备。下午1点40分，日本联合舰队终于发现俄国舰队的影子。8点55分，东乡平八郎在旗舰〃三笠〃号上升起〃Z〃字旗，发出了〃皇国兴亡在此一战，各员励精努力〃的号令，同时舰队大角度转向，与俄国舰队形成〃丁字形作战〃队形，堵住了俄国舰队的去路。双方舰队相距8000米，俄国舰队利用日本舰队转向的有利时机首先开炮，但炮击目标缺乏精度。日本舰队到相距6000米时才打开炮门。于是，从拿破仑战争到第一次世界大战期间世界海战史上最大的一次海战——日本海大海战就这样爆发。
经过3O分钟激战，波罗的海舰队旗舰〃苏沃洛夫〃号、2号舰〃亚历山大三世〃号和5号舰〃奥斯里亚别亚〃号3艘战舰相继起火，脱离战斗行列。到日暮时，俄国舰队的主力舰几乎全部被击沉或受重伤。这场空前规模的大海战胜负已成定局。当天夜间，日本联合舰队又派出驱逐舰和鱼雷艇进行袭击，再击沉3艘俄国军舰。28日，日本联合舰队乘胜追击，全部歼灭俄国波罗的海舰队。经过1。8万海里远道东征的这支庞大的俄国舰队，由于受到以逸待劳的日本联合舰队的攻击，总计38艘军舰中有19艘被击沉，5艘被俘，11艘逃往中国而被解除武装，只有巡洋舰、驱逐舰、运输舰各一艘逃到海参崴波罗的海舰队司令罗日杰斯特文斯基以及6000人被俘，4000人葬身海底，而日本联合舰队只损失3艘鱼雷艇，获得了压倒性的胜利。
高野五十六在27日傍晚受伤。由于〃日进〃号是第1战队的旗舰，遭到俄舰队炮火的集中攻击。担任舰长传令兵的高野五十六站在舰桥上担任记录。此时舰上已有人死伤。当27日白天的战斗快要结束的时候，〃日进〃号突然被俄国人的炮弹击中。高野五十六后来这样写道：〃轰隆一声巨响，剩下来的8英寸口径舰首左炮被俄国人的重炮击中。舰上顿时硝烟弥漫，遮住了战舰的前半部分。一股巨浪猛烈袭来，我不觉踉跄几步，左手手指嚓的一下折断两根，只连着一点皮。挂在脖子上的记录板也不翼而飞了。同时左腿也被弹片削去巴掌大的一块肉，鲜血染红了甲板。〃此役，〃日进〃号死伤人数近100名，而高野五十六也在其中，实现了自己为天皇效忠的理想。
随着日本海战的结束，日俄战争以俄国的惨败而告结束。1905年6月9日，美国向日俄两国政府提议媾和。在美国的斡旋下，经过双方一番激烈的讨价还价，最后签订了《朴茨茅斯和约》。日本完全达到了对俄作战目的，正如当时的美国总统西奥多·罗斯福所说：〃日本取得了令人惊异的胜利，获得了显著的成果。日本获得了满洲及韩国的驾驭权，得到了旅大和库页岛南部，又因为击败俄国的海军而自然地拥有强大的海军力量，在太平洋内除英国之外，造成了任何国家也难以匹敌的优势。〃日俄战后，日本海军的发展跃上了一个新的台阶，开始向拥有〃八八舰队〃的大海军发展。
如同日俄战争对日本海军的发展起了强刺激作用一样，日本海大海战也使高野五十六这个刚开始其一生血火历程的少尉赢得了其在海军发展中所需要的〃资历〃，实现了自己多年为天皇献身的理想。为表彰高野五十六作战勇敢，1906年4月豆日，天皇授予他六等功勋旭日章，并颁发奖金350日元。这段经历对他是如此重要，以致其在后来曾专门撰文写道：〃我从海军军官学校毕业不久就碰上了日俄战争，作为一名海军士官，能够获得实战经验实在是幸运的。当时我受命在三须中将阁下乘坐的第1战队旗舰'日进号'担任舰长的传令兵，在前舰桥写战斗报告是我的任务。怎么也无法忘记，在敌舰队投降的前一天，即明治37年（1905年）5月27日，以国运相赌的大决战在日本海开始了。有不少战友受伤。就在那一天，一发炮弹飞来，被击中的舰桥碎片打伤了我的左腿，并夺去了左手二指。在那一刹那间，我没有感到丝毫不安，只想到人在其岗位上应尽自己最大的努力。从那之后，虽然经过了30年的岁月，但这一信念一直未变。〃正是这一信念支配着他一步步忠实地执行了日本军国主义对外扩张的计划，并在这一过程中得以步步高升。
日俄战争两年后，高野五十六升任中尉，再过两年，升任大尉，成为训练舰队宗谷分队的指导官，负责来舰上进行远洋实习的少尉候补生的业务指导。随舰远航到中国的珠江口和广州湾一带，并到过北美、澳大利亚。其时〃宗谷〃舰舰长是铃木贯太郎。铃木也毕业于江田岛海军兵学校，曾参加过侵略中国的甲午战争，后升任大将，并担任过日本海军中最高荣誉地位的海军军令部部长和内阁大臣。高野五十六由于和野村贞少将的关系，与铃木相处融洽。野村贞是高野五十六的堂兄，在明治年间是唯一一位长冈出身的海军舰长。在侵略中国的甲午战争中，因其指挥的〃高千穗〃号战舰战功突出，与〃浪速〃号的东乡平八郎并称〃日本海军之双壁〃，对后来日本海军军官影响颇大。铃木作为少尉候补生实习航海时，曾得到野村贞的指导，因而对野村贞非常尊敬。据铃木的回忆，此时的高野五十六最引人注目的是其深思熟虑而果敢行动的性格。平常沉默寡言，认真指导候补生，默默地履行分队长的职务。在指导官开会时也很少发言，但一旦开口，即观点明确，坚持己见，每每都不得不采用其意见。
转年，即1910年12月1日，高野五十六被海军大学录取为乙种学生。在第一次世界大战爆发的1914年，他再次来到海军大学，被录取为甲种学生。
海军大学创立于1888年，是一所主要培养日本将校级军官的高等学校。学生最初分为甲乙丙3种，甲种主要是大尉，修舰炮。水雷、航海等高等学科，乙种主要是校官或大尉，可选修任意学科，丙种主要是少尉。前两类学生学习期限是1年，后者为半年。1890年进一步修改条例，学生种类改为将校科甲种学生。将校科乙种学生、机关科学生和选科学生。将校科甲种学生是有2年以上海上经历，且身体健康、业务成绩优异、富于敏锐的判断力、将来有充分发展才能，经所属长官推荐的海军大尉。将校科乙种学生是有海上经历1年以上者，主要学习舰炮、水雷和航海。高野五十六先后经过了乙种、甲种学习，度过了其在海军大学的学习生活，并在1915年被授予四等瑞宝勋章，晋升海军少佐，由此奠定了其在日本海军中发展的基础。
年轻的高野五十六在日本海军中良好的发展趋势，引起了故乡长冈人的注意。一些旧封建残余分子似乎从高野五十六的身上看到了振兴长冈藩的希望，于是筹划了高野五十六改姓的活动，以让高野五十六继承长冈武士名门山本家的遗业。
山本家族历代任长冈藩的家老，食禄1300石，是长冈武士的总头领。尽管封禄只有120石的高野家与之相差甚远，但长期以来，两个家族交往颇深，尤其是精通古典和汉学的高野家，更为山本家所倚重。至山本带刀这一�