坏土地改革和地方民主政权建设。这一时期的土匪已经完全堕落为国民政府发动内战的帮凶，残害人民的刽子手，必须加以消灭。而且，此时的共产党已经积聚了充分的力量。因此，在抵抗国民党军队进攻的同时，对为害后方的土匪武装进行了大规模的清剿和镇压。
剿匪部队边修桥边渡江进藏
比如，中国共产党为建立稳固的东北革命根据地，从1945年底，开始对东北的土匪武装进行大规模的武装清剿，摧毁了国民党策动和利用土匪从事破坏活动的阴谋。对于小股流窜土匪，各军区派出机动部队穷打猛追，连续作战，不给土匪喘息或分散潜伏的机会，同时发动群众，军民合力，进行搜山拉网，反复进剿，加以消灭。据不完全统计，从1945年12月～1947年4月，东北民主联军剿匪作战1303次，毙匪1。25万余名，伤匪1。85万余名，俘匪3。66万多名，降匪1。17万多名，共计歼灭土匪武装7。9万余众。曾经横行一时的谢文东、张雨新、李华堂、张伯钧、刘山东、孙永久、张乐山等匪帮均被消灭。
解放战争后期，全国各地相继解放以后，剿匪肃特成为巩固新政权的一项重要任务；许多隐藏下来的国民党党、政、军人员，分散在农村、湖区，与地主恶霸、封建帮会勾结在一起，狼狈为奸。他们四出造谣惑众，杀人放火，不断进行破坏捣乱，妄图颠覆新生的人民政权。针对这种情况，为使肃清匪特工作顺利进行，中共制定了正确的政策和方针，把军事清剿、政治攻势与群众工作三者密切结合起来。军事政治双管齐下，并以政治攻势为重点。总的政策是：首恶者必办，胁从者不问，立功者受奖。
宽大与镇压正确结合，总的策略是：争取多数，打击少数，利用矛盾，各个击破。总的方针是：以政治为主，军事政治双管齐下；以军队为主，军队与地方齐头并进；以外力为主（在初始时期和没有深厚民众基础的地区），外力与本地协同一致（参见江苏省档案馆藏，案卷号74…9，《剿匪肃特反霸资料汇辑》。（4001884），转引自蔡少卿《民国时期的土匪》，第326页）。
剿匪部队进军拉萨
这些方针政策颁布以后，各大军区和各级党政组织立即贯彻执行，进行了一场大规模的剿匪肃特运动。如热河地区，1945年10月～1948年5月，冀察热辽部队共进行剿匪作战869次，歼灭土匪19211人，大股匪患基本肃清。又如湘西地区，1949年10月～1951年1月，人民解放军12兵团47军进驻湘西，采取“重点进剿与分散驻剿相结合，军事进攻和政治瓦解相结合，剿匪与发动群众相结合”以及“孤立匪首，分化内部，降匪不杀，捉到的惯匪、匪首坚决镇压”（袁福生：《解放初期湖南剿匪概述》，《军史资料》1988年第1期）等政策，对盘踞湘西的土匪进行了大规模的武装清剿，歼灭土匪武装计10。2万余众，肃清了湘西为害600多年的匪患。再如广西地区，1949年12月～1952年l2月，广西军区集中14个师，加上地方独立团4400人，共计12。84万人，对土匪武装进行大规模的武装清剿，历时3年，共歼灭土匪46万余人，彻底粉碎了国民党企图以广西为反共前哨基地的迷梦。
凉山捕获的土匪
其它各地区也都出动军队，军民联合，对土匪实行清剿镇压。在西北地区，解放军驰骋在茫茫的腾格里沙漠、美丽的天山南北牧场、芦苇丛生的博斯腾湖畔；在东南地区，解放军搜遍沿海星罗棋布的岛屿、起伏连绵的丘陵山地、河网密布的水乡；在中南、西南地区，解放军追击在莽亘逶迤的大山间、不见天日的原始森林中、充满瘴气蛇虫的热带丛林里，短短的两三年内相继剿灭肃清了各地土匪，根除了千百年来任何政权都无法消灭的匪患。