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第二天早上，格雷夫斯和安全保安爱德华•；沃尔夫（Edward Wolf）阻止威金登上开往普拉姆岛的渡轮，命令他留在奥连特尖岬仓库的办公室工作。
一位不愿意透露姓名的官员认为，威金和库克都只是“替罪羊”。他说：“我们都应该为这次事故负责，尤其是高层领导。”威金和库克都觉得是农业部害了他们，进而觉得是幕后的一些人。库克告诉《新闻日报》：“其他人也应该和我们承担同样的责任。这样的惩罚简直就是私设法庭。”而威金说：“在适当的时候，我一定会把幕后的元凶说出来。”从弗罗里达回来的卡利斯对这二人的批评则是：“在安全措施的实行方面缺乏监督和管理，而且缺乏沟通。”
3个星期之后，威金又被允许回到岛上，但是不准再进入原先的办公室。卡利斯在老军队礼堂罕见地召开了全体会议，向大家宣告101实验室恢复正常工作。因为根据特别委员会的评估，安全漏洞都已经补上了。而此时，威金才意识到，自己早已被排除在委员会之外了，尽管卡利斯曾给他也安排了一个位子。回到家里，整个周末威金都醉得一塌糊涂，他想：“我并不是唯一该对事故负责的人！”他决定把自己的想法告诉卡利斯。
在周一交给卡利斯的信中，他写道：“我没有被通知参加会议，可能是因为我提出的问题会让安全主管（即沃克博士）和委员会主席（即格雷夫斯）尴尬。”沃克博士似乎对检测细菌的过滤器尺寸是0。3微米还是3微米并不清楚，但威金说：“这对于别人可能不重要，但是要知道，这两者之间可是10倍的差别呀！”对此有所了解的人都应当清楚，二者的差别就决定了没有病毒从实验室扩散出去，还是每秒钟都有成千上万的病毒逃逸出去。威金最严重的警告就是，他认为沃克博士和格雷夫斯的报告中，隐瞒了在101实验室过滤装置上检测到的严重漏洞。他说：“沃克的检测结果经常是100％，但实际上这是不可能的。因为运用深埋介质的方式进行的检测，其程度只能达到85％~90％。”在实验室再次正常运转之前，威金恳求卡利斯：“你应该看看下面这些东西，这应该引起你的关心。”
通风孔过滤器——我觉得它们都需要被检测，而且出现渗漏的应当进行更换。
消毒排水系统——我们都知道，根据最近的发现，有些管子已经被严重腐蚀。
材料供应——在这个实验室大楼里，如果因为仓库中零部件或供给物品出现短缺，可能会造成致命的问题。
关于卡利斯要求传看的特别委员会的报告，威金的问题是：为什么要明确指出普拉姆岛可以恢复正常操作工作？卡利斯对威金说：“我们以后再讨论这个问题。”但实际上，卡利斯根本没有把威金的话放到心上。对他来说，这只不过是失势的前工程负责人来跟他找碴儿。101实验室就是要重新恢复工作，这没什么可说的。
不过，岛上的蓝领工人对给予库克这样的处理感到愤愤不平。他们知道库克是个勤奋工作的人。“他是个好人，所有人都喜欢他。”一位同事说，“大家有问题都去找他。”自16世纪以来，库克家族就一直居住在长岛附近的索瑟德地区，是一个正直、自豪的家族，库克本人也是这样。“这些外来的科学家，居然想把我们这位本土的好人糟改成众人唾弃的坏人，没门儿！”150多名雇员，主要是普通的工作人员，联名上书，坚决要求恢复他的工作岗位，结束对他的处罚。迫于压力，害怕无法控制这种群情激愤的局面，以及担心失去本地公众的支持，普拉姆岛管理层决定恢复库克的职位。“我总算舒了一口气。”库克告诉前来通知他的一位媒体记者，“我想我也只能这么说。”
另外，大家还要求同时恢复威金的职位，但是没有成功，管理层要求大家安静一点，不要再闹了。威金与库克不同，为他平反，就意味着安全主管沃克得来承担事故责任。岛上的工会代表写信给卡利斯，质问为什么沃克一点儿责任都没有，但是却没有得到任何回应。调查委员会一位不愿透露姓名的成员站了出来，他匿名告诉当地一家报纸，认为把责任归咎于威金一人是不对的。他说：“你不能将事故责任推给一个人了事。其实在我们的报告中，非常强烈地暗示了安全主管应该负责。”但是，这位卡利斯亲自任命的安全主管最终还没有被撤换。说到底，科学家才是普拉姆岛能够存在的基础。
事后，一位曾经在岛上工作的雇员指着室外圈养的动物感慨万千，他说，还是要感谢普拉姆岛把有些动物养在了户外——它们是恭顺的哨兵。“感谢上帝，我们在62号楼（老牛农场）养着动物。”一位雇员说。说到底，如果没有它们，病毒爆发不会那么早发现，局面也就可能会难以收拾。
就在对威金和库克处罚令下来的当天，农业部总监察长办公室也宣布，要对普拉姆岛101实验室复原计划展开联邦调查。一位发言人说：“我们关心施工的质量问题。普拉姆岛上发生的事证明确实有这种必要。”
自从两年前こ炭始动工以来，大多数时候，威金都在对付大量朝令夕改的指令，都是对原先设计的修改，这大概就？40多项。原来的计划要求使用石料，但是出于对生物排污的考虑，全部改用了混凝土。金属隔气门的外包层错误地运用了环氧材料，结果导致严重起泡，只好将大约320扇门全部进行了更换。屋顶设计也有错误，导致夹衬发生渗漏。而约瑟夫•；莫顿建筑公司的报价则多出了500万美元，比预算多了50％。
由于工程筹划不周，出现了诸多问题，威金向华盛顿的农业部首席合同官（合同官是政府采购工作人员——编者注）提交了一份冗长的报告。在报告中，他列出了设计上的漏洞和施工的错误，并指出已经做过调整的工程，以及仍然存在的问题：
“已修复完毕的实验室大楼”还不是一个高效、安全、配备了完备的生物排污装置的场所，它仍然需要修复或更新。
在接下来的几个月了，我个人的信誉可能会受到诋毁和质疑。但有证据表明，最近的这次病毒爆发与岛上对一些相关问题的忽视有关。
为了留底，也为了保护自己，威金寄了一份复印件给德克萨斯的一位朋友。
要完成岛上所有相关设备的改造，农业部还需要付给约瑟夫建筑公司150万美元。建筑公司告诉农业部：“只要拿到余款，我们就能在4个月内完成工作。”有人指责威金也应该对这事负责，他们告诉《萨福克县日报》：“威金难辞其咎，他应该提前指出设计上的一些错误。”那么，他到底应该负责病毒爆发事故，还是建筑施工错误呢？或者是两者兼而有之？
1979年3月5日，农业部写信给约瑟夫建筑公司，要求取消1700万的建筑修复合同。而在此前一个星期，威金还拍电报给华盛顿农业部，要求追加至少50万美元的资金，以保证施工的继续进行。无奈之中，威金解雇了所有的建筑工人，只留下几个监工管理人员，但他希望这几个人能够自己解除合同。
第三部分“简直就是一团糟”
事情越来越糟。4月份的阵雨倾盆而下，却没有人指示该如何维护已部分修复的建筑。腐蚀性的盐水渗入接缝和横梁的连接处，不断腐蚀着钢架和金属材料，使它们锈迹斑斑。到了6月，农业部开始为完成工程公开招标，到7月中旬为止，投标的司已？4家。但是，农业部却还在继续开会，讨论该选择哪家公司。
卡利斯通知威金，对他暂时取消职务的处理仍将继续。同时，农业部总监察长办公室也怀疑威金从建筑公司那里收取了回扣。持相同怀疑态度的还有联邦大陪审团。大陪审团传唤了建筑公司总裁约瑟夫•；巴塔利亚（Joseph Battaglia），以及执行官塞缪尔•；桑布勒（Samuel Semble），要求他们提供相关文件、书籍和记录。
威金决定，在联邦大陪审团找他麻烦之前，再回到普拉姆岛上“捣乱”。他又向农业部发出了申诉信。农业部在回信中明白无误地表明，他们是和他站在同一边的，这无异于是给了卡利斯一耳光。农业部说：“由于文件中的推断过程和结论含糊不清、自相矛盾，所以我们并不认为，此次病毒爆发是你的工作失误造成的直接后果。”华盛顿方面承认，威金一直独自承担着所有责任，而这本应该大家一起负责。
于是，威金和他的妻子向纽约州最高法院控告普拉姆岛对他进行人格诽谤，要求赔偿100万美元。在控告中他指出，多年来他一直提醒岛上的高层，建筑中存在着漏洞和渗漏，而且他也明确告诉过卡利斯、格雷夫斯和沃克，101实验室的焚化炉在防止病毒扩散方面不起作用。他认为，普拉姆岛的行政管理层“把事故的责任归咎于他，并指责他犯下了罪行的行为，实质上是在诋毁他的声誉”。这其中也包括对他收受建筑公司50万美元贿赂的怀疑。
格雷夫斯博士反驳了这一控告，说威金从未递交任何实质性的警示信息。“产生的问题都在他的能力所及范围之内。”他说，“他并不是一个旁观者，而是一个参与者。”
尽管一切都朝着有利于威金的方向发展，但他重返普拉姆岛的行动却突然停止了。
“默隆•；威金和普拉姆岛互不拖欠。”《萨福克县日报》发表了这样的文章。在8月底底，这位48岁的工程师离开了服务18年的岛屿，他说：“我觉得继续留在岛上已经没有未来了。”由于他已经为联邦政府工作了25年，现在他已经有资格退休了。10年前，他曾经为休斯敦航空飞行中心设计过防范实验室，用来装载月球化石；澳大利亚人也曾想请他帮助建设他们的“普拉姆岛”。但是现在，他只能在阴影还悬而未决的时候匆匆离开。
“为了让我早点离开，他们给我开出了非常优厚的条件，尤其是金钱方面，简直让人难以抗拒。”威金说，“但是一开始，我一点也不喜欢这样的想法。”他最初希望能回到普拉姆岛，抛开所有困扰，重新开始工作。但是，农业部的官员见了他，承认他并没有做错什么，同时告诉他，他不可能再回到以前那种愉快的工作环境，劝他还是早点退休为好。威金还说，他听说普拉姆岛要私有化，觉得那样做未必合适。当然，也有人认他的提前退休不止是他说的那么简单。一位行政官员透露，威金之所以退休是因为他被告知，如果被大陪审团起诉，他将失去所有的退休福利。看来，普拉姆岛是用