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“马小九”从 2。4公斤被养成了马英九所形容的“高大英挺、气宇轩昂、一表狗才”，每天凌晨五点，它就会过来舔醒马英九，像个不需要电池的小闹钟。虽然都是家中稀有品种的男性，但马小九所享受的待遇却要比马英九高得多，马英九的早餐必须自理，马小九却由女主人周美青亲自喂食一日两餐，还常常开车载马小九出去散步。
将运动变成令观众尖叫每天清晨五点，马英九会穿着条超短小内裤，迈着双长腿，在台北的街道上健步如飞。看惯了办公室里一群挺着啤酒肚的男人，任何女人都会相信，眼前这幅画面实在很美好。
马英九是位运动不懈的男人，而且将运动变成了一件令观众尖叫的美事。他跑步，会穿紧身短裤；他游泳，会暴露两点，而且他以运动来锻炼自己的意志，“许多人在养成跑步习惯时，会发现自己很难克服想要偷懒的惰性，我的理论是：勉强成习惯，习惯成自然。方法是为自己营造一个情境，让所有偷懒的因素通通消失，或是减少到最低，让运动像吃饭、睡觉一样，成为每天生活的一部分。”
马英九的跑步哲学有“三不原则”：不半途退出，不半途休息，成绩不退步。但马英九也承认，这三不原则也正是慢跑的“三难”。
马英九形容跑步是“无产阶级”最“便宜”的运动，既不分阶级也不花钱，可以在运动场上跑，也可以在马路上跑。马英九在“法务部长”任内，还有百姓趁着跟他跑步的机会申冤告状，陈情检举，拉近了他和百姓之间的距离。参加社会公益活动的经历中，马英九陪残疾人跑过步，参加过单位举办的慢跑活动，也边跑边为“马迷”签过字。马英九成为名副其实的“慢跑明星”。
马英九跑步最快的记录是：3 公里/11 分 46 秒。他每天睡前要做 200个仰卧起坐，俯卧撑最高记录是连续做 120个。４０多岁的马英九，在民间举办的摩天楼爬楼梯登高比赛中，其拼劲不输２０多岁的年轻人，至今，已过天命之年的马英九，依然眼未茫、发未苍，许多熟人都说他跟当蒋经国的秘书时一个样，医生甚至说他的“内脏年龄”只有３０岁出头。这都是锻炼的结果。
很少有人知道，马英九跑步首先是为了健康，1974年，小马哥打排球扭伤了右膝盖，半月板出现裂伤，直到后来在美国纽约大学求学时旧伤复发，才动手术切除了受伤的软骨，医生便要求他以跑步来帮助复元。马英九做任何事都讲求一以贯之，这一跑，就跑出了心得，为了增强理论知识，他甚至还购买国外的专业跑步月刊来研究学习，最终将长跑运动坚持了下来。此外，他也发现长跑可以帮助他提高生活质量，“在我的家族中，祖父得年六十，最后因为中风而过世，我父亲也有高血压的毛病，所以我必须长期运动，维护我心脏、血管等方面的健康。”
马英九每年出境数次，在国外紧张到连观光的时间都没有，只好利用早上的晨跑来探索当地的美景。“我可以很自豪地说，全球许多城市，我几乎都知道哪里可以找到最适合跑步的地点。”在美国密西根湖附近，他在零下三十度的天气出去晨跑，跑了 15 分钟呼吸困难才打道回府；在新加坡，当地政府派出警官保护他，才跑不到一分钟就跟不上了，后来只好找来长跑选手跟着他；在德国波恩，他每次都跟莱因河畔的驳船赛跑；在瑞士的苏黎世，沿途如画的湖光山色，让他难以忘怀。小马哥亲近了全世界许多城市最清新宜人的时刻。
自从马英九掀起了跑步热潮后，许多人才第一次了解原来跑步运动没那么简单，而且跑步这种事情也可以上升到哲学高度。马英九最喜欢的演讲主题就是他的“跑步人生观”… 第一，凡事都要有准备；第二，人天生不平等；第三，不要怕输在起跑点。
由于膝盖的宿疾，医生也建议他勤游泳。每个礼拜至少有四个早上，马英九会在市议会的游泳池练习泳技。游起泳来，他一样是勇往直前，永不放弃，有时他忽然想起了某个技术上的环节不甚理解，就会立刻请教旁人。金溥聪就曾在夜宿的房间里，和同事分别抓着马英九的脚，教他怎么蹬腿。“Nothing is beyondthe training”，这是教育学家杜威的信念，而练习、练习、再练习，正是马英九的运动不二法门。其实马英九是在童年期差点惨遭溺毙之后，才发誓一定要把游泳学好。当年他在退潮时刻的金山海水浴场和家人戏水，却发现自己离岸边愈来愈远，情急之下，用尽全身的力气沉到水里，然后跳出海面大喊救命，这才被岸上的救生员发现而成功营救。
就像跑步带动了风潮一样，马英九穿着泳裤裸露两点的画面频频出现后，果然民众也跟着热衷起了游泳。不过游泳不比跑步般无场地条件限制，台湾的平价游泳池并不多，马英九也因此开始推动起学校的游泳池建设计划，并把原有的室外冷水池改成室内温水池，希望在一年四季，年轻学子都能藉由游泳而锻炼出坚强的体魄，也可以开放给一般民众来平价使用。
马英九十分欣赏“文明人的头脑，野蛮人的身体”这句话。有一本书对他影响最深，那就是罗家伦的《新人生观》 。罗家伦认为：“一个现代的青年要有文明人的头脑，野蛮人的身体，和不可屈服的意志。”马英九为它下的诠释是：“文明人的头脑指的是格局和器宇、真诚与智能。历史的潮流急遽推移，身为一个跨世纪的青年，面临时代的风云际会，想要引领风骚，必须具备优美的品性，轩昂的器宇，加上真诚的心地、清纯的智虑，才是世纪青年的典范，才是真正的e 世代。野蛮人的身体指的是体力和健康。我不喜欢有些人喊‘苍白的一代’、‘失落的一代’，苍白是一种病态，失落是一种颓废，愿大家在身体上一起加入野蛮族。不可屈服的意志绝非时下的‘只要我喜欢，有什么不可以’。我非常佩服屈原，他为了不向昏君屈服，宁可一死以明志，心自强，志不遥，定心广志，如此何所惧。这就是不可屈服的真谛。”
经历过的“性骚扰”
有人曾经对马英九提出过这一问题：“你心目中最美的女人是谁？”他毫不犹豫地说：“王清峰，因为她认真做事。无私的女人最美。”
王清峰是马英九太太周美青的同班同学，当年，王清峰当选台湾十大杰出女青年，就是马英九推荐的。台湾的色情业非常发达，日本男人成群结队来台湾访春买春，造就了这个行业的畸形繁荣。为了迎合日本买春客的变态心理，台湾黑道想尽办法营造市场，一时间，许多未成年少女被迫进入这个行业，雏妓问题，成为台湾的一大社会问题。
为了拯救这些雏妓，王清峰竟然勇敢地站出来，成立台北妇女援救会，出任第一任理事长，和那些背景复杂、实力强大的黑社会集团斗争，不惜以个人的生命相搏，真正是孤胆英雄。这种认真无私，感动了马英九。所以他又加了一句：“我台大法律系学妹沈美珍接棒，出任妇女救援会第二任理事长，投入拯救雏妓行列，也很美！”
至于明星方面，马英九也曾喜欢过几个人，但不是那种追星一族。比如初中时喜欢凌波，后来又喜欢过林青霞。至于他青年时代的影视明星，实在说不出几个。当然，现在又不同了，现在他也成了明星，常常都有和明星同台的机会，于是有了一大批明星朋友，像王菲、李玟、孙燕姿等，那是一种纯粹艺术角度的欣赏，而不是追星。
谁都不相信马英九是这样的人，常在河边走，哪有不湿鞋的？既然他身边有那么多美女，又是风情万种，哪个男人能够抗拒那种魅力？总有一天，他会湿了自己的鞋吧？台湾政坛，不知有多少人在盯着马英九的鞋，希望有朝一日看到湿迹。但马英九说：“君子慎独。”他说，他不是坐怀不乱的柳下惠，但他有一种办法保护自己的羽毛，那就是不给美女坐怀的机会。他说：“我每天戒急用忍，跑步、游泳、洗冷水澡，不会出事。”这话似乎表明，马英九并非不动心，偶尔也有男性本能勃发的时候，但他找到了解决的办法，那就是戒急用忍。
马英九也曾经遇到过“粉红色”遭遇。
马英九第一次遇到妓女搭讪，是与陈履安一起到美国去，在逛街时突然一个美国女人上来问：“Do you want to F×××！”单刀直入的粗鄙用词，吓了马英九一大跳。
后来有次他到匈牙利首都布达佩斯访问。一晚，与几位朋友沿着多瑙河畔散步，结果有几位流莺正在拉客，看到他们就跑来搭讪，由于在美国的“不愉快”经验，马英九避之唯恐不及，刚好有一团台湾观光客经过，大家认出马英九，马英九暗叫好险，要是被看到与流莺一起，那跳到黄河都洗不清了。
1997年，马英九赴莫斯科大学法律系访问，住在莫斯科红场旁的五星级饭店，有一天晚上九时回饭店，在房间附近有位盛装入时的俄国女子，用优雅而清晰的英文问：“Do you want a pany tonight ！〃 因为对方优雅而不粗俗，与刻板印象不同，马英九勾起了好奇心问：”How much？（多少钱？）“”Three hundredsU。S。 dollars。 “（三百美元）马英九闻言，心中有股沉重的悲哀，因为白天他才问过法律系几位国际法教授，得知他们一个月薪水竟然只有二百美元，学术沉沦，令马英九微微一叹。
马英九说他本来想告诉对方：“很抱歉，妳们的价格超过了我们行政院核定的公务人员出国旅费标准。”这就是马英九，机智、理性，又有些顽皮。后来他每天晚上回旅馆，都遇到不同的女人，马英九才明白这是“集团化”，而且与旅馆“挂勾”。
这么多年来，马英九当然或多或少会遇到一些“骚扰”的场面。基本上，马英九不太愿意去谈这方面的事，他不希望被骚扰，但马英九也尊重骚扰他的人。
有一件人皆知的事，在马英九担任“总统府副局长”任内，有位担任护士工作的周小姐，有妄想症，妄想快要成为马英九夫人，所以无论打电话或写信，都以“马英九准太太”的身份自居，后来经由张老师协助，送往荣总住院治疗，可惜后来周小姐拒绝做进一步疗程。马英九知道后说：“周小姐的母亲很早就过世了，我很同情她！”
2002年的 5月 4日，马英九在报刊发表文章论胡适精神。其实细察马英九的“柳下惠式哲学”，真有几分胡适的影子。胡适在处理自己与异性关系时，曾引用康德的话明志：“无论是对自己、还是对别人，都要将人道本身视为目的，而不仅是手段。”“要以人道作为最终的裁判。”马英九用理性与道德做自己最终的裁判，他不是柳下惠，他是“从论语中走出来的人”。
马英九的哲学是：“行有行规，每一行都要遵守行规。绝对不碰财与色，是政治行规，政治人物都应遵守。”他到�