是躲在后面伺机而动。
马英九的态度非常明确：“‘打造历史名城，共建美好家园’，这是全体市民的共同心愿，同样需要全体市民为之努力。城市违章建筑，破坏了城市规划，影响城市形象和城市管理，也影响了市民正常的生活和工作，市民反映强烈。这些问题不及早处置，迅速解决，不仅破坏我市的发展环境，损害城市形象，而且会严重影响社区居民的生活环境和生活质量。只有拆除违章建筑，才能清除威胁市民生产、生活安全的隐患，优化经济发展环境，提高城市竞争力，给老百姓一个明确的说法，给社会一个公正的解释，创造安全、舒适、文明、优美的人居环境。有记者采访，我欢迎，我还要呼吁记者多报道此事，一旦让大家都明白了，物主自然也知道，不让拆是不行的。”马英九拆违建，往往是先礼后兵，而且运用舆论支持，让被拆的人无话可说。
马英九拆违章建筑，最典型的案例，便是拆到他的党主席李登辉的头上。李登辉租住在台北士林区中社路 1段 9巷翠山庄高级别墅区，这个地区，仅仅只有16幢高级别墅，每幢别墅占地约 700平方米，周围有山有水，环境一流，是台湾权贵阶层的住所。李登辉所住的 13 号，位置极好，月租金是 30 万元新台币。有关资料显示，这幢别墅，系 1975 年取得使用执照，其后再未申请过任何建筑施工执照。该住宅 1980 年的面积不过 350平方米，但到 1994 年已经增建到 900多平方米。台“总统府”2000年更编列公费，为李登辉的“豪宅”再次进行修缮扩建，将原先的两层楼增建为 3层，使其面积再增加约 180平方米。为了这次修缮，台湾的纳税人为此支付了超过 2000 万元新台币。
翠山庄位于水土环境保护区内，有关部门规定，这类区域建筑高度不得超过7 米，建筑面积不能多于占地面积的 30 ％。李登辉却不听这么多，依然我行我素，先后两次扩建，已经属于严重违规。目前高度为 3层，超过 10 米，建筑面积超过占地面积的 65 ％，属于违法。在陈水扁任上，陈水扁对此不闻不问，视若无睹。现在马英九要拆违建，这幢别墅自然是最大的拦路虎。马英九不象陈水扁那样看人所作。马英九的态度非常明确，只要是违建，就一定要拆，不管对方是谁。
李登辉自然不干，站出来大打悲情牌，说马英九是反骨仔，他一下台，立即就翻脸不认人。为此，台湾舆论一时大哗，沸沸扬扬吵了好几个月。几乎所有人都拿眼睛盯着马英九，看他将这个现国民党主席前“总统”怎么办。马英九却不顾这些，公开表示，一定要公事公办，“一视同仁，即报即拆”。对违法用地违法建筑必须要以铁的手腕，重拳出击，从严治理。因此，市政当局向李登辉发函，规定 10 日内自行拆除，否则将派员强制拆除。
马英九说，陈水扁好斗，行政时比较喜欢冲撞、对抗。无论是处理政务还是处理竞选，他都体现这一风格。但马英九自己性格不一样，他比较温和，如果要区别一下的话，陈水扁比较严苛，马英九虽然也是学法出身，但他更偏重于儒家的以德治政，希望施以宽仁。
他说：“同样是达到目的，但是不一定要付出比较高的社会成本。我没有那么强势，好像缺乏魄力，其实，事情还是做成了！……没有破坏社会和谐，族群对立不严重。我觉得这是王道、中道的做法，传统儒家的做法。”这一点，马英九说得十分清楚明白，这也确实是他和陈水扁甚至是其他当政者的区别。同时，这也是马英九一直受到攻击的地方，几乎所有的人，包括那些支持马英九的人，都觉得他太弱，太温和，缺乏魄力。
有一位资深传媒人评价说：“不光马英九温和，他身边的那帮人，和他的性格非常相近，同样是比较温和。所以，他的整个班子，看上去都缺乏一种魄力。但是，尽管如此，马英九事事处处以身作则，给人一种信赖和鼓舞，这说明马英九没有一点官僚架子，是一个真正为市民办实事的人。”
连任台北市长2002年，为寻求连任台北“市长”， 10 月 27 日，马英九正式成立其竞选总部。国民党几乎全员出动为马英九打气。党主席连战，副主席蒋仲苓、吴伯雄、王金平，马英九竞选总部主任委员江丙坤，以及多位国民党籍“立委”、党籍县市长都到场为马英九加油“挺选”。
台北市府团队也在副市长欧晋德率领下，一齐穿着白夹克向民众致意。亲民党的秘书长钟荣吉亦赴现场表示对马英九的支持。两三千名支持马英九的群众，把竞选总部前的整条八德路挤得水泄不通。马英九在台上提出“让台北成为台湾的骄傲，让台北市民成为最后的赢家”两个目标，并重申追求“优质选风”的理念。
“总统”陈水扁则为李应元站台及上街头游行造势，与 10 月 16 日李登辉之女李安妮的站台效应相比，陈水扁对于李应元选情的拉抬明显大于李安妮。在“台北市民较青睐谁呢”的调查中，有 43。62％ 的人支持马英九，29。27％的人支持陈水扁。陈水扁于是批评马英九“心目中只有中华人民共和国，只有香港特首董建华，没有‘中华民国’的陈‘总统’”。但在民调中，有 68。34％ 的民众不同意这种说法，只有 15。45％ 的人同意其说法。
马英九说，他不但要赢得选举，也要挑战他自己、挑战全世界与台北市发展情况相当的城市，赢得未来 4年台北市的升级。引人注目的是，尽管民进党阵营不断进行大规模的造势，包括播出电视广告、举办大型晚会，马英九阵营始终显得很低调。马英九说，台湾经济不景气，他要“精打细算、省吃俭用”，不会为选举砸钱。
台北“市长”选举首场辩论会 11 月 10 日在台北市公务人力发展中心举行，辩论会分三阶段，第一阶段为政见发表，第二阶段是由主办单位澄社、中国时报、联合报和自由时报等代表发问，第三阶段是双方交叉提问辩论，经过抽签决定后，由马英九先辩先结，李应元后辩后结。李、马阵营在辩论会后都随即举行记者会，发表对对手和自己交锋表现的看法。
由于马英九比李应元高出七八厘米，主办单位为使画面好看，方便摄影机取镜，特别帮李应元订做一个垫脚台，让李应元站在辩论台前和马英九有同样的高度。
与以往不同的是，此次辩论会第三阶段进行“交叉提问”，双方各提问一分钟后，由对方申论两分钟，共提问八个问题后，由双方进行结辩。马英九在结辩时说，选战辩论应回归到市政方面、避免无谓的政治口水战、避免抹黑。
随后台北“市长”选战中的电视政见会如期举行，民进党籍候选人李应元却以“没有交叉辩论”为由缺席，争取连任的国民党籍候选人马英九大唱“独角戏”。据台湾《联合报》报道，李应元声称，电视政见会没有交叉辩论，收视率又不高，效果不大，他不愿参加。马英九则认为，政见会是很重要的沟通渠道，参加政见会是候选人的义务，也是对市民尊重的表现，即使收率不高，总比在肥皂箱上发表政见有效果。马英九并指出，在前两次电视辩论会中，李应元对马英九的提问回避得“很厉害”。马英九在政见会中发表体育、教育、文化、客家、人权等“人文关怀”面的政策愿景。他宣称，“不将市民做为工具、要将市民当作目的”。选举结果自然是可想而知。
直接影响到台湾前途的台北“市长”选举，经过两个多月的竞争，执政的民进党推出的候选人李应元，在陈水扁和李登辉双双支持下，使出了浑身解数，试图取马英九而代之。但因马英九为人的品德非一般所能及，而为百姓服务的真诚，更为多数选民欣赏，所以马与李的民调支持率为 60 比 20 ，相差悬殊。
心思诡诈、花样特多、手段极辣的李登辉，为了打马英九、挺李应元，在 11月 20 日与媒体对话时竟提出：“马英九应该竞选‘总统’，让李应元当‘市长’。”李应元听到李登辉的这一主张，及时回应，感谢“前总统”对他的支持，称赞李登辉为活字典，与他是亦师亦友的关系。
对李登辉要马英九选“总统”的主张，李应元解释为：李登辉看到四年来的市政建设停滞不前觉得忧心。事实上，李登辉打马用心是很深的，终极目的是要消除外省根。国民党的幕僚与部分立委私下评估，马英九可赢李应元 20 万票以上。陈水扁也拿马英九的外省籍大作文章。企图煽动族群对立。对此，马英九对陈水扁予以了坚定的回复。
马英九说：“台北市是一个移民城市，三分之二的市民不是在台北出生，因此本是一个多元包容、族群和谐的城市，但是四年前的‘市长’选举就已经听到陈水扁‘市长’阵营许多似乎是故意挑起群族意识的言论，例如：土狗与贵宾狗、包子与比萨，甚至直接指控我是‘新卖台集团的棋子’等等，如今又将我的出生地拿出来做文章。我想，大家都看得出来是谁在将‘族群’这个话题拿来当成选举议题来炒作，台北市民需要的是真正关心市政发展的‘市长’，而不是一个只会谩骂、攻击的政客！
“因此，本人在听到这种言论时，就诚恳、良心地呼吁‘国家元首’应自重，发言要审慎，不可如此轻率，不但给国人不好的示范，也损伤了‘总统’的威信，这样子叫为人父母的怎么教小孩？我想‘总统’以这样负面竞选的手法来撕裂国家认同，对台湾的民主进程实在是一种伤害，况且伤害的不只是我个人，而是整个社会。
“另外，我也要恳请李应元先生不要为了选举胜利，不计一切手段乱扣红帽子、乱贴标签，尽快能够回到他一再强调的优质选举，否则不仅不能让台北市长选举成长台湾的骄傲，更会进一步造成民主的倒退，长远来看，实非台湾社会之福。”
选举结果正如人们所预料的那样，以马英九的全面胜出而告终。
2003年，马英九成功连任台北市长后，他的目标就定在要把台北打造成世界级城市。他说，第一要打造一个产业城市，加强在高科技资讯或者生物科技上的优势，同时把台北变成会展中心。此外，还要进一步扩大台北南港、内湖两个高科技区。这样，当大型商展会议在东亚举行时，就会考虑选择台北。传统产业部分，在配合商店区的建设过程中，把部分地区改成徒步区，让商机可以恢复。
第二是打造安全城市。台北是台湾大都市中最安全的一个，犯罪率低，同时民众对安全满意度也很高。交通也是一样，台北市 02 年车祸死亡人数为 81 人，几乎是有史以来的最低数字， 01 年这个数字是 98 人，以前都是三位数。为什么会取得这样的成绩，因为强力执法。马英九自己的座车被开过 14 次罚单，包括 4次超车，10次违规停车。他没有用特权销单，而是按规定付钱。他自己在街上走路也规规矩矩，走斑马线。
台北是全台湾行人违规处罚最严厉的，有人觉得马英九疯了，选举年居然严惩行人违规，难道不关心选票了吗？马英九的答案是我比较关心他们的生命，因为行人违规死亡率在所有交通事故中占第二位，仅次于机动车。他�