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哥伦布一美国公司拥有几千个小时的录影带、数千张幻灯片，都是4 年之间在同一海底现场拍摄的。1991年，他们制造了品质优良的光纤电缆，海底的影像可以点滴不漏地传到控制室中的17部监视器，让科学家们亲眼观察和研究实际的环境，不必借助样本或化石。科学家们发现了13种新的生物，其中一种海绵已经获得确认、分类，并且完成命名。
他们拍摄到一条特大的章鱼，触手张开时，两端长达6．5英尺，而一般章鱼很少超过1 英尺。研究发现，它的触手排列和吸管构造不同于所有已知的章鱼，换言之，这是新发现的品种。
还有一次，录影机拍到一条长达22英尺的大鲨鱼，而纪录中最大的只有3．5英尺，两者相较，简直是大巫之于小巫。服务于马里兰大学、有〃鲨鱼女士〃之称的克拉克博士（Eugenie Clark），鉴定其为格陵兰鲨鱼（Greenand Shark ）。它的体型庞大，需要大量食物。这证明了深海海底食物链的丰富。
哈佛大学的透纳（Ruth Turner ）博士在现场进行实验，发现了全新品种的深海木头虫，粗如雪茄，长达半公尺；文献中的木头虫只有铅笔大小。这个发现推翻了以前的说法在此之前，科学家认为专吃木头的海虫只能生存于浅海之中。
以前发现的珊瑚都生长在浅海的沙质海床，细根分散，抓住海底沉淀物，就像地表植物一样。他们新发现的扇形珊瑚，根部像手，能够抓住煤炭、钢铁或黄金，因而适应了生存的环境。
某次一艘潜艇撞到海底的〃泰坦尼克号〃铁壳残骸时，无意中发现了铁锈中的少数细菌。〃中美洲〃号沉船现场也发现了同样的细菌。科学家可以利用这种知识，研发防止深海锈蚀的方法。将来制造深海采矿设备或设立深海监听站时，这都是必须解决的问题。
这些深海探险最令人兴奋的一个结果，应该是发现许多生物可以应用于制药工业。这些新发现的生物，可能是用来制造〃肿瘤抑制素〃的抗癌药物；例如科学家在现场发现的〃雪梨歌剧院海绵〃中，发现了这种抗癌物质。
这些科学家都来自著名的研究机构或大学，他们的研究工作继续不辍。下次汤米再度出海到新地点工作时，他们的工作将再获得加强的机会。
1989年哥伦布一美国公司宣布发现〃中美洲〃号残骸时，历史学家蒙蒂·康拉德（Judy Conrad ）组织媒体，发起追踪〃中美洲〃号乘客后裔和亲人的运动。她收集列有生还者居住的市镇名单，然后发函当地报社，附上名单和相关资料，寻求协助。
最初她获得了29个答复，包括了两个孟勒夫的直系后裔；他们提供了孟勒夫横越美洲以及搭乘〃中美洲〃号旅途中所写的手稿。她又逐渐找到诸如贺登船长、玛丽·史温等人的后代。目前她还和106 位当年搭乘〃中美洲〃号的乘客后裔或亲戚保持联系。1989年，鲍伯曾经提到在沉船现场发现的两个皮箱：〃看起来相当脆弱不堪，其中一个盖子已经掉落，皮箱是打开的。两个箱子里都住了一些深海生物。要点在于把里面物件的原始情形做成永久记录，以供未来研究之用。现场科学研究的目的之一，就是希望翔实记录发现时现场的实际情形。〃缺了盖子的皮箱里有一顶帽子，两本书。鲍伯希望捞取它们，相信里面的资料一定可以使整个故事甚至内战时期的历史增添丰富的内容。
其中一个皮箱终于在1990年捞起，里面确实蕴藏了宝藏一件衬衫用汽船版的《纽约时报》包着，报纸的日期是1857年7 月20日。报上的文字仍然清晰可辨。还有13件亚麻衬衫、长短大衣、裤子、裙子、晨袍、几双袜子、香水、蒸馏水、金表、手枪和一件东方风味的小雕刻。这只皮箱真是考古学的宝藏，它们都是伊士登夫妇的财物，其中一些是亲友赠送的礼物。
缺盖的皮箱属于〃艾伦号〃最后救起的旅客约翰·迪门特（John Dement ）所有。当年〃艾伦号〃的船长应伊士登的请求，多巡回了一圈，结果又救起布朗和约翰。箱中装了64件衣物、一个装着刮脸用具的革囊、三本小说，还有一封介绍信。小说和信件的重要性不在它们的内容，而在浸水130年之后，字迹居然清晰可辨。
他们还寻获了约翰·乌得本（John Woodhouse Audubon）绘制的鸟类和动物的素描。这两百张图画都是他于1849年到1850年间，在美国西南部和加州研究当地动物时画的。他在1850年返回东部时，拜托友人带回纽约，后来辗转相托，由史蒂芬（John Stevens）带着搭上〃中美洲〃号，不幸遇难沉没。
39家保险公司在〃航海家〃进港当天，向联邦法院递状控告，当年他们已赔偿了〃中美洲〃号的损失，因此打捞到的黄金应该归他们。除了一家伦敦保险公司的会议记录，曾经提到董事们讨论提拨5 万英镑分摊保险支付以外，其他公司依据的都是当时的报纸报道，提不出提货单、收据或是合约当作证据。听证会开始以前，凯兰法官先就依据资料剔除了21家保险公司。
1990年8月，凯兰听取其余保险公司的主张。他认为，132年来，这些黄金留在海底，保险公司从未设法打捞，实际上已经放弃这些黄金的所有权。他判决哥伦布一美国公司拥有捞获财物的全部所有权。保险公司上诉第四巡回法庭，合议庭的三位法官意见不一，在1992年8 月26日撤销原判决，发回凯兰法官，要求依据海难援救法，重新审判。巡回法庭认为，所谓〃放弃〃需有表示放弃的动作才能成立，保险公司确已证明和这些黄金有所牵连。虽然如此，判决文中仍然明示：哥伦布一美国公司理应取得宝藏的绝大部分。
哥伦布一美国公司不服这个判决，上诉到最高法院。很多著名社团都公开支持，最高法院不愿进行审判，案子又发回给凯兰法官。
1993年7 月，凯兰用了两个星期的时间，听取包括打捞的难度、费用、风险以及资金的证词。这是联邦法院的管辖权首次延伸到公海的沉船上，也是海事法庭第一次接受〃远处所有权〃的观念，承认了法律必须随着科技的进步而扩大疆域，还必须保护文化资产。凯兰认为哥伦布一美国公司对于保护这些资产的努力，无可匹敌。
结果，凯兰法官判定投过保的黄金90％归于哥一美公司；未经投保的，则全数归哥一美公司所有。他还保留了那10％已投保黄金的决定权。此外对于任何乘机要求分享黄金的请求，他一概予以驳回。哥一美公司和保险公司均不服判决，又再上诉第四巡回法庭。第四巡回法庭于1995年6 月14日宣判，维持凯兰法官原判决。判决书开头就表示：
本庭对于从事史无前例的勇敢尝试的打捞者，获判取得捞获宝藏的绝大部分，觉得并无不妥之处。
接着判决书陈列公正分配捞获财物的六个考虑因素：（1）花费的劳力；（2）打捞者的技术和精力；（3）用于打捞工作的装备成本；（4）风险；（5 ）捞获财物之价值；（6 ）财物本身所遭遇的危险。关于第一项因素，法院调查发现，从1986年到1992年，哥一美公司在海上工作487 天，工作人员分成两班，每班工作12小时，累计多达40万工时，成本几达850 万美元。而据法院调查所得，此前有关打捞海底沉宝的案例，只有两例工作时间超过一个月，〃哥一美公司的努力，规模空前庞大〃。
关于第二个因素，法院一改平时稳健保守的看法，对于哥一美公司和汤米的成就，大为赞扬：〃哥一美公司表现的勤奋、技术和毅力无人能望其项背。它的努力树立了今后的评判标准。〃
第三点，水下载具已命名为〃尼摩〃和〃北极发现者号〃，加上其余打捞装备，光是材料成本就超过600 万美元，如果加计技术成本，更是远超此数。此外租用设备、支付相关事项的费用，也超过百万美元。就法院所知，没有其他打捞工程的成本堪与哥一美公司相比。至于工作的风险，法院认为：〃发现者〃在离岸160海里的外海使用笨重的打捞设备（〃尼摩〃重达6吨），如果发生意外，送医急救需数个小时……船只出海，船只和人员都暴露于危险之中。
第五个因素探讨的是捞获财物的价值问题。专家做证时的估计虽有差异，但黄金总值约有10亿美元之多，为数颇巨，为史上所仅见。法院完全同意一位专家的意见：黄金的高价值，加上杰出的努力，理应获得优厚的酬劳。
法官们认为，海洋对于黄金的性质固然不至于构成伤害，但黄金一旦沉入深海，捞获的机会不大，作为财产的价值以及继续存在的机会，都面临重大危机。哥一美公司的作为，就是把这些财物从极端的危险中完整拯救出来。
审判期间，哥一美公司要求海事法庭决定捞获物分配时，应该考虑第七个因素：发现者对于残骸或货物的历史价值、考古价值及其资料价值的保存所做的努力。巡回法庭认为凯兰法官听取了专家的证词，承认哥一美公司对此已经尽了全力，成果斐然。他们对此极表同意，做出如下的结论：捞获物的分配问题，极少出现如此有利于打捞者的判决……然而本案事属例外，地方法院所做90％的决定，虽然优厚，本庭却认为完全恰当，并不过分。巡回法院还授予哥一美公司全权处理宝藏的行销事宜。保险公司要求立即取回应得的黄金，但法院裁定：黄金数量太大，以交由一家公司单独处置为宜。1857年〃中美洲〃号沉没时，黄金的损失严重影响当年的财经情势。此次捞获，显然亦将有重大影响。本庭接受专家意见，认为统一的处理计划，有助于从贩售本批黄金中，获得最大的利益。
从1989年秋天诉讼程序开始以来，还有一件事情悬而未决：〃保险公司是否能够证明当年确已付出赔偿金？哥一美公司认为保险公司所提的恐怕只是表面证据，他们应该证明当年接受保险的部分和付出的赔偿金额。法院接受这个抗辩。〃哥一美公司取得90％，并不等于保险公司可以平白获得其余的10％。巡回法庭又要求凯兰仔细斟酌证据，以确定保险公司确能证明全部或部分的主张。裁定文中还指出，保险公司如果没有百分之百的证明，哥一美公司可以取得其余部分。巡回法庭对于整个案件的结语如下：汤米·汤普森和哥伦布一美国公司的成就非凡，整个故事充分显示了美国的创意、才智和决心。
这种赞扬，在一向严峻保守的司法界空前罕见；法官们也幸运地在19和20世纪的重大历史故事中，占了一席之地。
从年底直到1996年初春，两方各把理由呈庭。这时医师诊断凯兰法官罹患胰脏癌， 只剩下两、三个月的寿命。但他还是带病从公，在春天完成裁定书，然后在6月去世。
凯兰利用当年的报纸作为取证的主要来源，发现两家保险公司确曾支付赔偿金；另外两家则通查不到任何证据。所以，哥一美公司应得增加为92．22％，而保险公司应得的部分，则为哥一美公司扣除打捞、储存和行销等一切费用之后的7 ．78％。其实保险公司根本无法呈交提货单、保险契约或收据。行家认为，凯兰此举意在消除以后的纠缠。事实上，〃中美洲〃号装运�