逮南京巡抚、右副都御史艾璞下狱。先是，魏国公徐俌与无锡民家争田，璞归田于民。俌赂刘瑾，差官覆勘。使者乘瑾风旨，悉以其田予勋戚，且劾璞前勘非是。瑾矫旨逮赴诏狱讯之，璞不屈，曰：「此实民田也。」瑾怒，棰之几死，数日方苏，谪海南。
罢礼部尚书李杰。时晋府镇国将军袁槏赂刘瑾，求封郡王，杰持不与，曰：「皇帝祖训无载也。」瑾矫旨许之，而勒令杰罢去，复起前礼部尚书张升代之。升初以忤瑾致仕，已而复不合，罢。宁王宸濠厚赂刘瑾请复其先世已革护卫，瑾矫旨与之。
刘瑾等诬逮工科给事陶谐，廷杖落职为民。谐前后上疏戒逸游，远谗佞，停止不急工作，差官卖咸织造，皆直指群奸欺蔽之罪，瑾等以是大恨之。已而复以他事逮之理，捃摭百端，终不屈，杖戍肃州卫。
五月，以讲官詹事杨廷和为南京户部右侍郎，学士刘忠为南京礼部右侍郎。旧事，御经筵毕，必献规谏语。是日，廷和、忠直讲既罢，上谓刘瑾曰：「经筵讲官耳！何多词？」刘忠与廷和皆旧东宫官，奏曰：「二人当令南京去。」遂有是迁。时南部无缺，皆添注。虽升之，实远之也。忠谓廷和曰：「此行须别瑾否？」廷和曰：「瑾所为如此，不可再见之，人知必以我辈交瑾矣。」忠深然之。廷和乃以蜀锦辞瑾，瑾曰：「刘先生不足我耶？」遂厚廷和而疏忠。时刘宇为中枢，托保国公家人朱瀛者，交通刘瑾，日数往来。兵部郎中杨廷仪，廷和弟也。每俟瀛出，必招入私署，留坐款语。四司官有不附宇者，瀛必言于瑾，令外补。廷仪独谄谀宇。廷仪能文，宇章奏皆廷仪为之。
吏部推总督两广右都御史熊绣掌南京都察院事，刘瑾矫诏令致仕。绣在兵部，结怨中贵。至两广，供应裁革，日唯廪给数升而已。瑾使人踪迹，其人叹息而去，瑾竟不能害。致仕归之日，虽纸笔药饵，一无所取。
六月，给事中许天锡手具登闻鼓状，力陈时弊，怀中不敢奏，自经屋梁死。天锡在弘治中素言事，有气节。时给事中郄夔覆视榆林功次，瑾私人冒功多，夔难所纪叙，亦自经死。给事中周钥使还，当赂瑾，无所借资，自刎桃源舟次。
刘瑾议革天下提学官，吏部尚书许进谓提学作育人材之本，执奏不可，止之。太监李荣传旨：「御马太监谷大用父奉、御用太监张永父友俱升锦衣卫指挥使。」寻俱进都督同知。此内臣父兄授官之始。
秋八月，钦天监五官监候杨源奏：「自正德二年以来，火星入太微垣帝座之前，或东或西，往来不一。」劝上思患预防，意盖指刘瑾也。瑾大怒，曰：「源何官，亦学为忠臣耶！」矫旨逮送锦衣卫，杖三十，谪戍肃州，至怀庆卒，妻度氏斩芦荻覆尸，葬于驿后。源父御史瑄以劾曹、石谪戍岭外，犹幸生还。源忠直不愧其父，而身遂不免，朝野悲之。
刘瑾改其侄婿纳粟监生曹谧为千户，起其妹夫致仕礼部司务孙聪赞画大同军务。冬十月，南京户部尚书杨廷和入朝，命改廷和为户部尚书，兼文渊阁大学士。南京尚书入阁，自廷和始。
起张采复为文选司郎中。采美丰仪，先为文选郎，与焦芳相得，给事中刘（艹洍）劾归。至是，芳荐采于刘瑾。采，故瑾乡人。谒朝数日后，始往见瑾，瑾喜迎，笑曰：「好乡里。外官多不知事，朝后即来。乡里迟来，最得也。」时许进议调验封郎中石确于文选，疏已入，而瑾欲复用采，迫进追回用石确疏，以采易之。寻复以采为右佥都御史。而合水韩鼎者，亦由瑾升户部侍郎，与采同廷谢。鼎先谢老不任，拜起，又吃吃不能致词，谷、张辈屏后群笑之。瑾甚愧，曰：「且看此人！」既谢，皆叹曰：「好男子，此不负所举矣！」采归过瑾，瑾设酒肴预待，曰：「非都宪，我为老韩愧死矣！」相得益欢。
十一月，刘瑾矫诏革天下巡抚。始遣科道查盘各边刍粮。刘瑾素知边方召商中纳积弊，遣科道官三年一次查盘。回奏内有粮粗粃草浥烂者，瑾矫旨逮系各巡抚及管粮郎中下狱。既至，锁扭押至所任地方，勒令加倍赔偿。凡各商人纳过粮草，未给价银，皆没官不给。由是商贾困弊，边储日乏。刘瑾矫诏裁革天下按察司兵备官。
十二月，逮顺天府丞赵璜下诏狱，斥为民。璜任济南知府，裁抑镇抚中贵，故瑾恨之。巡抚四川都御史刘缨谓蜀水恶，请开通巫山道，可自彝陵达夔州。旨未下，遂开道。瑾矫旨械缨下诏狱，廷臣论救，释之。
三年（戊辰，一五０八）春正月，刘瑾令朝觐官，每布政司纳银二万两。考察朝觐官，既上奏，翰林学士吴俨家故富，刘瑾尝有所求，俨不与，御史杨南金者，都御史刘宇廷挞之，不堪辱，养病去，瑾矫旨缀奏尾，曰：「学士俨，帏幙莫不修，其致仕。御史南金，无病欺诈，其为民。」逮李梦阳下锦衣卫狱，寻释之。梦阳代韩文草疏，瑾已谪出之，犹未释也，复罗以他事，械至京下狱，将置之死。时翰林修撰康海与梦阳同有才名，各自负不相下。瑾慕海，常欲招致门下，而海不往。瑾恒先施，海辄玻渫龃鹬共灰患Ｖ潦牵窝艨妥笫险撸栌锩窝粼唬骸缸哟奚芬樱∥┛底涌梢越庵！姑窝粼唬骸肝嵊肟底铀夭幌嘞拢袼郎适纪兄焕⒂谛暮酰俊棺笤唬骸覆晃嚼钭佣シ蛑乱玻 骨恐伲窝裟艘云绞槭郑唬骸付陨骄任遥ǘ陨轿芫任摇！苟陨秸撸１鸷乓病Ｗ蟪质橐韬＃Ｔ唬骸甘浅显谖遥移窳叨袢酥晃加岩槐芫桃玻 顾煲梃ｈ笙玻又蒙献：Ｔ唬骸肝籼菩谌胃吡κ浚韫谌撼迹课畎淄蜒ァ９苤酰俊硅唬骸讣吹蔽壬邸！购Ｔ唬骸覆蝗弧＝窭蠲窝舾哂诶畎祝晃魏斡淄蜒ピ眨 硅唬骸复顺⑹隆＝裎琶蔽壬贾！购Ｋ旖獯胫锸锉鹑ァＣ窝粲墒堑檬停Ｓ腓矗诡厩逡橐印�
左都御史屠滽掌院事。一日，上审录重囚本，内写「刘瑾传奉」字重复数多，瑾怒骂之，滽率十三道御史谢罪。御史跪于阶下，瑾数其罪斥责，皆叩头不敢仰视，久乃起。
二月，起前都御史雍泰提督操江。先是，马文升、刘大夏交荐之。及给事中潘铎等复疏：「泰有敢死之节，克乱之才。」许进荐于瑾，瑾以同乡故起之。乡人谕泰谢瑾，泰曰：「进退在天，若奈我何！」
三月，改翰林院编修顾清等为部属。时焦芳子焦黄中会试中式，芳意欲得大魁。既而取吕抩第一，黄中居二甲首。芳谓诸执事抑之，遂入言于刘瑾，改清等官，而授黄中简讨及刘宇子刘仁等六七人俱为庶吉士。数月，黄中、仁等俱擢编修。
刘瑾修理庄田，擅掘天、地坛后土，侵厂官地五十余顷，毁官民房屋三千九百余间，发民间坟二千七百余冢。降湖广按察司佥事汤沐为武义知县，罢江西按察司副使陈恪。
恪、沐为御史时忤瑾，故降之。逮御史涂祯下狱死。祯，江西新淦人。初为江阴令，治行奏天下第一，征为御史，差巡长芦盐课。刘瑾欲令割送该年余盐银两，祯不从，瑾衔之。后祯复命，俟于朝门。遇瑾不为礼，即矫旨下锦衣卫狱，杖戍肃州卫，祯重伤死于狱。仍行原籍，查祯男涂朴，起解补伍。瑾败，始得释。
逮前总制三边都御史杨一清下狱，寻释之。先是，一清巡边，上疏陈战守之策，请复守东胜，开屯田数百里，省内运。奏上，报可。一清遂兴筑边墙，克期完工。而刘瑾憾一清，罢之，工亦止。至是，又恶其筑边糜费，下诏狱。大学士王鏊言于瑾曰：「一清有高才重望，为国修边，可以为罪乎！」李东阳亦力救，乃得释。
夏四月，刘瑾假湖广灾伤为名，奏遣同乡侍郎韩福出理粮饷。福科敛剥削，馈银数万。已，复命福兼副都御史，督理湖广逋赋，民甚苦之。逮御史王时中下狱。正德初，时中抗疏论瑾，瑾衔之，识名于屏。已而时中巡按宣、大，见纲纪隳弛，极意振厉。总督刘宇，瑾私人也，常以赃吏嘱时中，不从。瑾既憾时中，宇复譛之。瑾矫诏逮系，令荷重枷，露立三法司之前三日，数踣且殆。李东阳援之，得释。
以王佐为南京户部尚书。时遣科道稽核各边粮刍，先后巡抚宪臣多坐累系狱。佐一日同尚书顾佐等见瑾，瑾言及兹事，曰：「朝廷必大诛戮，乃大惧耳。」佐曰：「本朝未尝戮大臣。」有毁尚书许进者，瑾语诸大臣曰：「许进奸邪，若尚书刘宇可为吏部。」佐曰：「佐与刘尚书素厚，与许尚书交浅；然许素有望，恐刘尚书不如也。」毁之者因曰：「王佐党进。」瑾怒，遂有是迁，欲姑遣之去而徐图之。
刘瑾矫诏令进士陈璋致仕。璋登弘治乙丑进士，既归，欲终身养母，母让之曰：「不闻舍孝子而为忠臣者乎？吾得汝禄养足矣。」促北上。至是抵京，值瑾窃政获罪，遂矫命令致仕。许进宣言于朝，曰：「古今曾有进士致仕者乎？」欲援之而力不能。同事强璋贿瑾，璋曰：「官以贿成，吾不为也。」怡然就道，及家甫二旬而母终，议者谓天所以成孝子也。后瑾诛，应诏起用。
五月，南京大饥，刘瑾矫诏敕运米三十三万石，转恤凤阳。南京兵部尚书何鉴执奏，言留都地方重于凤阳，灾伤甚于淮西，止之，始得遣官赈济。刘瑾矫诏籍没已故户部尚书秦纮、通政强珍财产，家属遣戍。
西厂太监谷大用遣逻卒四出，刺南康民吴登显等三家，以端午竞渡，擅造龙舟捕之，籍其家。自是，偏州下邑，见华衣怒马，京师语音，辄相惊告。官司密赂之，人不贴席矣。
六月，镇守太监廖堂荐举内外官，预拟升调，吏部多徇之。吏科给事中何绍正劾堂虽奉旨，察贤否注迁，当付吏部。上责堂，下所荐于御史。执朝官三百余人下诏狱。时早朝有遗书丹墀者，上命拾以进，则告瑾不法状也。瑾大怒，矫旨跪百官奉天门下，诸监立门东监之。有顷，命大臣出。翰林院官东向跪，曰：「内监雅待众翰林，敢尔？」亦使出。御史等官东向跪，曰：「御史习知法度，亦宁敢尔？」瑾不听。时暑甚，僵偃十数人，命曳出。内监黄伟忿曰：「书中所言，皆为国为民。好男子死即死耳！何不自言，嫁祸他人为？」瑾努目曰：「是何好男子！不露章，乃匿名。匿名，固死也，矧御前！」拉诸监入，李荣曰：「入矣，公等俛而舒。」令内竖掷冰瓜焉。有顷，瑾还来，荣曰：「来矣！」皆还跪。瑾目之怒，复入。至暮，尽送下诏狱，长安鬻饭者，争饭百官市中。明日，李东阳疏救，瑾微闻出内寺，乃得释。上手匿名书，曰：「汝谓贤，吾故不用；汝谓不贤，今用之。」遂退李荣、黄伟，任瑾益专。
逮前户部尚书韩文下狱。瑾已勒文落职，怒不已，乃以户部广东司遗失簿籍，遣官校械系至京，下锦衣卫考讯，欲置之死。监禁数月，罚米二千石，赴大同亲纳。时诸大臣忤瑾去者，瑾俱诬以旧事，令输粟塞下。尚书王佐、张缙、杨守随、何鉴，都御史熊绣、孙需、戈瑄等皆不免。鬻产不能给，称贷以偿，缙绅为之骚然。
给事中安奎、潘希曾，御史张彧、刘子励俱以查盘，后先忤瑾意，下狱。奎、彧荷校且死，李东阳