卓格寺，以后传播教法至赛噶寺、孜朗寺、塔木寺、阿华寺等大寺院。目前，约有僧人千人多，上面提到的大师多罗那他的遗物中之袈裟现在藏在该寺院内。
《卓格寺寺志》中讲，其寺极盛时管辖阿坝、马尔康地方的大部分觉囊派寺院，有〃子母十八寺〃之称。从夏尔措·南喀坚赞初建寺始，依次上师十五人，主持大师是：夏尔措·南喀坚赞、贡宁曲然坚巴、本洛衮噶巴桑、曲江顿珠、衮噶伦珠，克尊云丹伦珠，衮噶伦珠之灵童晋美旺波、晋美却吉迥尼，衮噶·桑杰仁钦、衮噶·云丹嘉木措、贡却曲桑、贡却丹白尼玛、衮噶·嘉森样嘉木措。除衮噶巴桑外，名声较大的还有第十一任主持卓格·云丹嘉木措。
现在该寺主体建筑有：大经堂两座、护法殿一座，内供更钦·笃布巴·喜饶坚赞大师、上师多罗那他、释迦牟尼佛及其近待弟子阿难、迦叶、三世如来、无量光佛、事部护法、不动金刚等镀金铜像二百一十多尊，还有很多药泥佛；及共计藏文经一千三百余种，其中以金汁所书《般若八千万颂》两套，以银汁书成的大藏经两套；并藏有本派高僧文选及格鲁派的达赖、班禅、章嘉活佛等大师的著师。
第一章 中观他空见地
觉囊派和其它藏传佛教的教派一样，不仅有自己独特的修行方法，而且在显宗理论方面也有不同于一般的解答。
觉囊派之见地同宁玛、噶当、格鲁一样是依中观论的，属于经、有、瑜伽、中观四大派别之中观见地。而于中观学内部的自空、他空分别则依他空之理。那么中观自空和他空有什么区别呢？自空论讲，一切世俗谛和胜义谛所摄诸法都是从我们主观上成立的，即我们所认识的一切被我们以为实有，其实是主观上假设成立的，而并非实有。他空论讲，一切世俗只能称为世俗法，所谓之〃谛〃不过是在我们的认识能力有限的主观中成立的。故，讲世俗之空为自空。换句话说，世俗诸法依缘起性生灭，依缘而生依缘而灭，所以我们讲的一切实有是抓不住什么的，通俗点儿讲是〃自己空自己〃。然，胜义谛法任何时侯都不是从人的主观上空的，从一开始，不论其被不被我们所认识，乃至完全被认识，都不会有丝毫的改变。比方说，世俗法无实性为空，其空性即为胜义谛，那么胜义谛的空性就成了连个〃空〃都不可得的东西。〃世俗无实，胜义谛亦无实。〃那好，在讲此话的同时你已经将其认为〃实〃了。故再以一切皆空不实去推你认为是〃实〃的这句论述，恰恰自相矛盾。
如果讲自空，细细品味是有点儿不大合逻辑的，为什么呢？当我们认识一个东西的时侯，仔细观察其相不难发现万物是虚相之海市蜃楼，其相非真，那在不实的背后总会有也应该有一个构成他外表不实的内在。从哲学上讲外部现象是内在的表现，那么内在性质既是现象的本真了。一切事物，现象不实，本真亦不实，其事物是根本无法成立于世的。世俗与胜义谛是一体的，在这里一定要强调二者为统一体，对于一事物来说。世俗谛是其现象，胜义谛是基本质，绝非一物一部分是世俗一部分为胜义谛。因为世俗以智慧观察不实故，无常故，所以称观察出其本质为实，若以自空讲的胜义谛不实亦空，就是说一切事物你就别想知道他到底情况是怎样的了。这样的危险在于，众生的本性为何？既说众生本性为佛陀，又说了一切本真无实，结果还是自己在这里绕圈子罢了。
前面提过了觉囊派所依之他空前地是佛陀三转法轮所传的，三转法轮之理论是究竟了义的，那么他空见对于众生是如何看的呢？
从胜义谛讲，众生都具有一个〃如来藏〃，这种〃如来藏〃即是众生本具的如来的大智慧，他常恒、坚固、离戏、寂静、圆成、自性成、实义有。可以进。〃如来藏〃是未离客尘位的有自性清的法性，一切有情众生都具有清净，故说〃如来藏〃有谛实性。但是，千万千万不要以为我们都具有〃如来藏〃就不用修行清净和忏悔罪恶了。如果真的具有〃如来藏〃不用修行的话，那么本身应该清净无垢的众生为什么有贪、嗔、痴三毒，有罪业呢？这看起来似乎是具有〃如来藏〃的清净和现实生矛盾，但以〃如来藏〃之特性观并无对立。〃如来藏〃之清净是本来，但他却有〃客尘〃。打个比方来吧：以太阳喻〃如来藏〃，大好睛天为究竟清净一佛，以乌云比客尘。太阳不会在什麽时间什么地方矢去光明，常照大地就是〃本来之清净一睛天，〃但客尘云朵遮障日光才有了阴雨天气。所以我们众生天天没好天，年年没好年，无时无刻不在阴雨中。可以讲，佛法是一阵清风，又胜过清风，永远地吹散了我们心里的乌云，还〃如来藏〃以本来之面目，所以要修心做善。
通常的中观派即自空中观论者，认为一切有情成佛时所依之处是污染心的真如法性，为成佛之种之，即菩提心为因，闻法、遇善知识、修持为缘，因缘相应生成果。听起来颇有道理。我们先不去讲他空和自空之别，简以一切中观共同认识去判别其说法，中观学谥为一切法因缘生成果，依缘生必依缘灭，假以一物因缘具足而成果，一旦众缘相持之平衡坏掉，那果便灭了。故因果关系必为无常不实之世俗法，反过头来看，成佛尚要因果相成那必无常，这种佛无常的奖罚哪个教派也不会承认吧。他空讲〃如来藏〃或说真如自性从胜义上讲就是佛，这也和大众的讲法即〃佛为觉之有情，有情乃未觉之佛，两者无甚别，只在觉之迷之间〃相同。所以说，即便自性空的空的理论从推理上讲过得去，那么说空，谈有，众生总得有个归属之处才和佛性吧，这个统一体一定是不生不灭的，无变化的，无为的，真实存在之体，这种胜义有能说空吗？胜义谛自性并空，只是我们执着加上的〃他〃使之空了，故名他空而非自空。人类就是为的了摆脱生死，摆脱生灭变化规律才去追求不生不灭的真实境界的。胜义谛空的讲法即滞定了真理之存在，要是真理无实，善恶、因果的存在也就没有什么意义，大家干脆不要学佛好了。因为无真理学他何用？
觉囊派所持他空见地并不一味只谈有有有，也承认、强调空性。但空性只是因缘相合之诸起法，强调的目的是要破除我们对世俗的以虚妄为实的执着。真实之胜义谛是圆成实性的，不生灭的、不来去的，乃诸法之法性。更钦·笃布巴·喜饶坚赞大师说过：〃胜义圆成实，不论佛出世与不出世，法性和诸法所依之界常在而不可以为空〃。
顺便提一下，要是有谁想研究一派宗见的话低下头学才好，不然根本不懂就听人乱讲，自己也跟着乱说，不仅果报不好，更障碍了自己的解脱道路。这一定要小心！
第二章 理论原渊源及当代学习情况
第一节 教法渊源
有人认为觉囊派的他空见地非佛说而是觉囊派的僧人自创的见地，这里要谈谈法的源流总理。
佛陀的了义大中观（他空中观）的法源亦如喜玛拉雅雪山之水一样绵绵不绝，上澜到头仍是佛陀。前面说过释迦尼佛第三次转法轮所传的中观他空理论依经典很多。如《如来藏经》、《大法鼓经》、《央掘魔罗经》、《胜曼经》、《妙臂请问经》、《大般涅磐经》、《宝云经》等大量了义诸经。阐释经义的大师有：弥勒、龙树、无著、世亲等。弥勒菩萨曾在《现观庄严论》略提他空之义，在《庄严经论》、《辩中边论》、《辩法性论》等中做了详细之解。龙树大师也在《赞颂集》、《法界颂》里提出胜义谛不空的中观了义思想。
觉囊派的诸上师中，更钦·笃布巴·喜饶坚赞大师著有《了义海论》等六经函，至尊上师多罗那他也写有《妙集中观论》、《如宝中观论》等二十四函作品。再有玛达哇·吐登格陆嘉措著述显密教法著二十四函书。还有喇嘛措尼的近代最著名的《中观庄严论》和《偏袒灯光论》等等很多典章。
第二节 学习情况
觉囊派的僧人入寺后，一般先学习藏文拼写和书法，以及各种必要的仪式酥油糌粑花供的制作技术。因觉囊派经典很多是手抄本，所以特别重视草书和缩写的辩认。结合学的藏文，开始背诵一些短的如《度母颂》、《归依经》、《忏悔经》、《佛顶大白盖陀罗尼》、《不动佛陀罗尼》等经文。待有了一定的的基础后，通过学习《法行论》了解佛教的基本知识。以后经十到十五年的显宗学习毕业后再进入禅院修密法三年，始称〃扎哇〃并经过长期学习完成圆满次第，有资格传授灌顶的才称〃剌嘛〃译为上师，此乃很高的地位和荣誉。故此其它民放族泛称藏传佛教出家人为喇嘛是很不准确的。
近代觉囊派僧人学习的文献主要以本派高僧的著作为主，内容可分七个方面：
1。《时轮经》，及六支瑜伽法。
2。弥勒学说的二十部作品：A：〃慈寺论〃即《现观庄严论》、《庄严经论》、《辩中边论》、《辩法性法论》、《宝性论》。 B：〃五部地论〃为《本地分》、《摄抉择分》、《摄世分》、《摄异门分》、总称《瑜伽师地论》。唐玄奘法事共译汉本一百卷。C：无著的二论是《阿毗达磨集论》、《摄大乘论》、D：世亲的〃八品论〃即《三十颂品》、《作业品》、《五蕴品》、《疏理品》、《庄严经论释》、《辩中边论释》、《因缘经释》。
3。印度古德的〃对法七论〃，即迦多衍尼子的《发智论》、世友的《品类论》、天寂的《识身论》、舍利子的《法蕴论》、目犍连的《施舍论》、拘瑟耻罗的《集异门论》、和满慈子的《界身论》。
4。上下对法，乃无著的《大乘阿毗达磨论集》和世亲的《阿毗达磨俱舍论》。
5。古印度因明论师陈那的《释量论》、《定量论》、《理滴论》、《悟他论》、《关系论》和《诤辩论》。
6。佛陀所说的《律分别》、《律事本》、《律上分》、《律杂事》等根本律典。
7。金刚曼、阎魔敌等各种本尊瑜伽密法。
一般考格西要学完因明学、般若学、俱舍学、中观学、戒律学，声明学和时轮经，各寺还有自己的寺规纪律。显宗的学习制度基本上就是这样。
第三章 密法简要
密法是藏传佛教的重要修行内容。密法亦叫〃金刚乘〃，乃依止方便智慧无二分别的金刚道而现证三门金刚，觉悟成佛。各教派都有自己的具代表性的最高法门。觉囊派尤其重视密法修行。
和其他教派一样，觉囊派弟子在先学显后修密，显密兼重的理论前提指导下对因明、中观、俱舍、般若、戒律熟读于心，通达无才可学密，如此方不是〃漏器〃。从初入门的三皈依、忏悔、发菩提心等显密共加行到大忏悔金刚萨缍法，修善业曼扎供养法，接受佛力加持上师瑜伽法等不共加行，直至金刚上师的灌顶加持都要严格进行，认真修习。觉囊派的灌顶多达百种，以上，常见的有：时轮金刚灌顶、时轮九神灌顶、不动明王灌顶、马头金刚灌顶、毗那迦夜天灌顶、宝生随许晨百法灌顶、阎魔敌灌顶、雅曼德迦起尸母八法灌顶、胜乐五神普明灌顶、瑜伽母灌顶、长寿灌顶、莲花生燃智灌顶、大悲观音缦灌顶、金刚持灌顶等等。
觉囊派常见的修