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有人会问，菩萨以度生为事业，为什么要独处山中静处修定不顾众生呢？这的确是误会，因为菩萨的身体虽然暂时舍弃度众之行，但他的心根本没有舍弃众生。譬如一人身患重病，暂时为了疗治身体而停止作一些事务，但病痊愈后会一如既往地做事。同样菩萨怜悯众生在寂静的地方服禅定之药，得到真实般若智慧，消除一切烦恼业障重病，发起六神通，化身三界六道之中，对广度无边众生，有很多的功德与必要，所以菩萨应该发起如金刚般的坚固心，一心修习禅定。在此引用经教宣说修禅定的功德。《大灌顶经》云：“禅思比丘无他想念，唯守一法，然后见心。”《遗教经》云：“夫心者，制之一处，无事不办。”《阿含经》云：“乃至成就三昧，灭除暗冥，得大智明，皆由精进修习，乐静独居，专念不休之所致也。”这样明确了知修禅定的必要和功德应当进入真正的禅修，在此之前应该分清菩萨真正修行的法，并不是以色界四禅，四无量，无色界的四空定，二乘无漏禅定为终极目标，而是修习大乘不落二边中道之不共法。菩萨初发心修禅时，不为生死，不为涅槃所以不落二边。为了积集福德所以不住在无为中，为产生智慧所以不会住在有为中，所以菩萨入一切禅定时，在禅定中发起无生智慧，此时心与法性相应，所以能不住生死涅槃的边。这也是菩萨真正要达到的目标，所以最初就要确定下来。若依大乘了义禅波罗蜜来说，不必依定生慧，禅定就是定慧圆明之出世无漏大三昧。
进入禅修的方便分五种，一具五缘，二诃五欲，三弃五盖，四调五法，五行五法。
一者，具五缘。一守持清净戒律，若有毁犯，如法忏悔；二具足衣食资具和药物；三安住在寂静的地方；四摒息一切外缘杂务；五有善知识引导开示。
二者，诃五欲。一切众生常被五欲羁缠绊缚，因此产生种种损恼忧患，追求五欲如火上加薪，永远不会满足。被五欲所烧灼，如逆风执火炬一样，五欲的毒蛇咬得众生痛苦不堪。一切众生贪著五欲到死都不愿舍弃，被五欲奴役驱使，后世堕入三恶趣中感受无量痛苦。我今天修禅，要远离五欲大贼。如《禅经》云：“生死不断绝，贪欲嗜味故，养冤入丘冢，广受诸辛苦。”了知五欲的过患罪恶，心中畏惧舍弃，如避怨敌，由于远离它使心中清净，贪欲之念不会生起，这是修禅的要点。
三者，弃五盖。即贪欲盖，嗔恚盖，睡眠盖，掉悔盖，疑盖。此五盖生起会断正定善心，盖覆观照觉知的正念，所以当毅然舍弃。一、诃贪欲：《四十二章经》云：“佛言，人怀爱欲不见道者，譬如澄水致手搅之，众人共临，无有睹其影者。人以爱欲交错，心中浊兴，故不见道。汝等沙门，当舍爱欲，爱欲垢尽，道可见矣。”偈云：“诸欲求时苦，得时多怖畏，失时怀悲恼，一切无乐处，诸欲患如是，已诃能舍之，得福禅定乐，则不为所欺。”二、诃嗔恚：偈云：“杀嗔则安隐，杀嗔则无忧，嗔为毒之根，嗔灭一切善。”三、诃睡眠：放纵身肢，卧床不起，致使意识昏冥，五根暗蔽昏散称为睡眠。它能断坏三世一切利乐福德，如此恶法最为不善。偈云：“汝起勿抱死尸卧。种种不净假名人，如得重病箭入体，诸苦痛集安可眠。”如人被缚将去杀，灾害垂至安可眠。结贼未灭害未除，如共毒蛇同室居，亦如临阵白刃间，尔时云何而可眠。眠为大暗无人见，日日欺诳本人明，以眠覆身无所见，如是大失安可眠。”四、诃掉悔：即断除身体游手好闲，杂戏放荡，口的喜欢唱歌吟咏，争辩是非，无益谈论，喜问闲言碎语，以及萦惑人心的下流绮语恶言，心的心情放荡，纵意攀缘，思维文艺，世间才技，一切邪想恶念。偈云：“汝已剃头著染衣，执持瓦钵行乞食，云何乐著戏掉法，放逸纵情失法利。”即平时放掉散漫，当欲入定时心中生起忧悔障盖定心。五、诃疑盖：疑心生起覆盖定心，不得定心虽入佛法，如入宝山而空手返回终将一无所得，所以一定要断除。有三种疑，即疑自己，疑师善知识，疑法。偈云：“如入大歧道，疑惑无所取，诸法实相中，疑亦复如是。疑故不勤求，诸法之实相，是疑从痴法，恶中之恶者，善不善法中，生死及涅槃，定实真有法，于中莫生疑，汝若怀疑惑，死王狱吏缚，如狮子搏鹿，不能得解脱。在世虽有疑，当随妙善法，譬如观歧道，利好者应逐。”除此五盖心中清净寂静快乐安然，如日月远离罗睺的障蔽光辉明朗。
四者，调五法。即调节饮食、睡眠、身体、气息、心五种。如陶师要造众多器皿，先应善巧调拌泥土，使之不硬不软，然后才能烧制出妙器，又如琴师善巧调节琴弦，演奏之时才能发出妙音。
同样修心也必须善加调理此五种，务必使其和顺适中，这样三昧才会没有障难容易生起。
五者，行五法。即欲、精进、念、巧慧、一心五种。欲就是发起修禅的志愿和意乐之心。精进当具足身心二种精进，抖擞身心断诸不善法，励力奉行善法。念，忆念世间及出世间一切禅修的殊胜与可贵。巧慧，善知禅境得失正误，或明了内外方便善巧运用，速得禅定。一心，修行者善巧抉择判别，用功不错，应一缘不散而安住。比如要行路，要熟悉道路通不通，如果明确了知，就意无反顾地前行。
遵从这样的次第去修持，则一定会稳当而快速地生起禅定。譬如善巧调驯良马，驯服之后，就能任运驱使驾驭。
己六、般若波罗蜜
分四：一、体相；二、释词、三、分类；四、摄义。
颂曰：修持甚深闻思修智慧。
子一、体相
具有四种不共法相之拣择法的善心及种子；或者，通达五明处等智慧。《菩萨地》云：“谓能悟入一切所知，及已悟入一切所知拣择诸法，普缘一切五明处转。一内明，二因明，三医方明，四声明，五工巧明，当知即是菩萨慧之自性。”般若是诸佛究竟之秘藏，是法身理体，是众生本有的妙性。般若能破愚迷生死之幽暗，能达涅槃解脱之彼岸，能作六度之导航。如《般若摄颂》云：“谁求声闻独觉果，乃至法王如来果，皆依般若法忍得，离此恒时不可得。”龙树菩萨云：“慧为见不见，一切功德本，为办此二故，应当摄受慧，明是求法义，乃大解脱本，故应先敬持，大般若佛母。”也就是说，智慧是今生后世一切功德的根本，为了成办这两种功德，应当于自相续中摄受智慧，并令增长坚固。以此智慧明了通达诸法实义，这是获得解脱之根本，因此，首先应当恭敬读诵受持大乘般若教典。《入中论》云：“如有目者能引导，无量盲人到止境，如是智慧能摄取，无眼功德趣圣果。”布施、持戒等五度，若没有般若摄取引导，则成为世间的功德，是有漏之因，若由般若摄受，则成为出世资粮，是证菩提果之因。永明延寿禅师说：“信根、精进根、念根、定根、慧根，五根中最主要的是慧根。”信心等的修行功德、其违品的过患、断除烦恼及种子等善巧方便，都依靠智慧分别抉择。如吉祥勇菩萨云：“信等根中慧为主，如余根中须意识，有此为主知得失，亦能善巧断烦恼。”出世间的五度皆依靠智慧，又诸菩萨将自己的身肉布施给来求者，如从药树而取，没有傲慢怯懦等，这也是因为现证真实智慧。又由于智慧，能够观察生死、涅槃所有衰损，为了利益他众，修学戒律，令持戒清净。由慧能通达安忍的功德与不安忍的过失，令心调伏，那么邪行、众苦等不能动摇。由慧能善知所应精进之事，而勤修持彼道。又住真实静虑所有最胜喜乐，也是由慧依止正理所引发，所以，净施等五法以慧为依。
若无智慧作摄持，布施如无眼目。《般若摄颂》云：“俱胝瘦他47无导盲，路且无知岂入城，五度无慧如无眼，无导非能证菩提。”行布施等五度，若无智慧作引导，不可能获证菩提。如吉祥勇菩萨云：“无慧求果报，施体不能净，利他为胜施，余唯为增财。”又云：“无破暗慧光，不能成净戒，多由无慧故，尸罗成浊染。”又云：“慧倒心混乱，不信住忍德，不乐观善恶，如无德王名。”又云：“心不勤修慧，其见不能净。”若未发大慧光明，愚痴黑暗终不可灭，所以应勤修习令发智慧。如云：“故应尽自一切力，于如是慧勤修习。”愚痴之因谓近恶友，懈怠懒惰，极重睡眠，不善于观察选择，不解大乘经义，未知谓知，起增上慢，不乐亲近诸有智者，世人虽修三摩地，但是若无智慧光明，不能断除我执，如经云：“世人虽修三摩地，然彼不能断我想，其后仍为烦恼恼，如增上行修此定。”唯独修习无我慧，才能永断三有根本。如经云：“设若于法观无我，此因能得涅槃果。”
子二、释词
梵语曰般若，即智慧。决断是智，简择是慧。又知俗谛是智，照真谛是慧。《大乘义章》云：“照见名智，解了称慧。此二各别，知世谛者，名之为智，照第一义者，说以为慧。”《法华经义疏》云：“经论之中多说慧门鉴空，智门照有。”
子三、分类
分三：一、闻慧；二、思慧；三、修慧。
《经观庄严论》云：“随次闻思修，得法及得慧，此智行此法，未得勿非毁。”若人于善知识处能以正确的方式闻法，次于法义能正确忆念，再次于真实境界得生正智，最后得证道果，而后获得解脱智，此智慧随之深入而能行持闻思修之法。如果自己没有这种智慧，不应断言此非佛语。龙树菩萨云：“增盛智慧即是闻，与思此二若具者，能够生起修智慧。”
丑一、闻慧
听闻上师所讲正法后，自己能如理如实地理解法义。也就是经听闻正法后所生起的智慧。所闻境：一是般若经典及解说般若经的论典之内明；二是为了摄受世间众生所需通达的共同四明。共同四明即：为调伏他人所需通达的声明与因明；为摄受他所需通达的工巧明、医方明。为获得一切智智果位，需要听闻并学习通达以上五明。如《经观庄严论》云：“若不勤学五明处，圣亦难证一切智，故为调伏及摄他，并自悟故而勤学。”又云：“诸佛子众无须学，彼等一切悉非有。”尤其是通过听闻而彻底通达佛法含义，善加分析了义与不了义等，以此方便来衡量了知其真实义，这种智慧就是胜观，属于胜义谛。抉择胜义谛，其理论有五大因：一、观察本体之理论是离一多因；二、观察因之理论是金刚屑因；三、观察果之理论是破有无生因；四、观察因