从内到外依次穿着白色金刚密衣、红色上师衣、兰色咒衣、藏红色祖衣、红色丝绸大氅，头戴莲花帽。此帽为三种形状，本仪轨中所戴名为“见解脱帽”，内外两层表示生圆二次第双运，顶端三尖表示三身，五种颜色表以五身饶益众生，日月表示智慧与方便，蓝边装饰表示三昧耶无边，金刚宝顶表示三摩地不动，鹰鹫之顶翎装饰表示见解证悟到极点，修行已趋于究竟的标志。头戴莲花帽，现十六岁童子之形以表示十六种不变大乐，披散着头发表示法界与智慧无方广大，具足无比相好，圆满报身服饰，以双运之方式拥抱益西措嘉空行母，表示智慧方便无二双运。此处亦可不观想与空行母双运之相，观想莲师左侧斜倚着天杖，亦是双运的标志，同样可以表示显空大双运、明空大双运、觉空大双运之义。
身圆自生续部之坛城
本传上师空行守誓等
安住如同解开芝麻荚
如是乌金刹土智慧尊
犹雨融入观修之所依
上师莲师五身圆满，周围旋绕无数彩虹，于五彩之光网中明点遍布，无勤幻化自生续部之无尽坛城。于上师莲师之头顶上，观想一切大圆满根本传承上师层叠而坐，一切空行护法守誓等，稠密有序地安住，如同解开芝麻荚中的芝麻一般，一切印度八大持明，八十四位自在瑜伽士，藏地君臣二十五尊，二十四处、三十二地、八大寒林和三处的勇士、空行、护法、财神等犹如云涌自然围绕在上师周围，如是明观之后，再观想从乌金刹土迎请莲师父母、持明空行等降临，如是一切智慧尊犹如天雨降入甘露海一般，融入观修之所依（所依指自己观想于头顶上方的莲师父母、本传上师、空行、守誓等圣众。）。次以诚敬之心，念诵金刚七句祈祷文，祈求上师皈依境加持吾之相续，偈颂为：
！乌金刹土西北隅
莲茎花胚之座上
稀有殊胜成就者
世称名号莲花生
空行眷属众围绕
我随汝尊而修持
为赐加持祈降临
格日巴玛思德
此七句祈祷文是一位具殊胜成就的空行母所传，有不可思议的大加持力，无论何人念诵，莲师立即住于其前赐予加持，其意义即：吽表示获得一切悉地，观想在乌金刹土的西北隅，达那郭夏海中之莲花茎上有珍宝组成之花胚，胚上有日月之座垫，彼上坐着具有无量希有传记之殊胜成就者，世称名号叫莲花生，在莲师圣者的周围，有无数空行眷属众围绕着，为了求得莲师及其刹土的所有证悟的空行眷属等之加持，我追随汝与佛无别之圣尊而修持，为赐加持故，祈请阿弥陀佛的化身，莲花种姓的总集上师速速降临，令我相续得到与您无二无别之一切胜妙悉地，故而念诵格日巴玛思德吽。
此祈请颂可以说是莲花生大士应化南赡部洲的略传：
莲花生大士未出世以前，佛经中早已授记，应其授记，于释迦牟尼佛涅槃后八年的农历七月初十日，在西印度达那郭夏海中一株五色大莲花花胚上，化生出一相好光明、端身趺坐之童子，此即是莲花生大士。大士生而成佛，当时天降甘露沐浴大士，一切天龙及海中水族齐来顶礼，大士当即传法于海中女神。
西印度国王恩渣波德亲往海中莲花上抱回宫中立为太子，很快让大士继王位，大士在位时具有轮王七宝之瑞。后感金刚萨埵空中现身告曰：汝乃教主，实非政王。不久莲师舍弃王位而出家，事师阿难尊者，受修释迦牟尼世尊预嘱传付之法。凡显密仪轨、究竟法义，皆深得释迦牟尼如来口诀。阿难尊者为说戒时，持地佛母奉献袈裟，十方诸佛现身加持，同赞善哉。大士复虚心苦行，历事诸师，精通天文、五明等诸学，在印度、尼泊尔、古塔婆幽静吉祥地，勤修禅定得三约嘎。于秘密主金刚手、金刚佛母、普贤如来受无上密五部心传大法，法尔成佛总持门，即身成就无量寿如来无上悉地。大士请求金刚佛母传外内密一切法要时，佛母曰：密无师承，不得滥学，宜先灌顶。大士便求一切佛现身灌顶。佛母哈哈大笑着说：善哉。乃为灌顶。大士自见一切佛入于自身，身体变成吽字，现前观音化身成就。复为灌嘛哈母札顶，一切义理开显，现前观音报身成就。复灌马王佛顶，三业清净，慈悲现前，微细烦恼了不可得，现前观音法身成就。
又于金刚大总持世尊，受金刚阿阇黎灌顶，化身说法八种外密，报身受用八种内密，法身根本八种密密悉皆成就。其实这些全是大士权巧示现，大士早已证得五智，究竟法身与普贤王如来无有别异。大士为调伏刚强难化诸有情故，现威猛相，一切天魔外道，闻名慑服。在印度尼泊尔传法度生历九百余年，智悲双运，威德普闻，众生沐其法雨顿登十地，直证佛果者，其数无量。
后应西藏王赤松德赞之聘请，由印度入西藏弘法，而为藏密第一代祖师。在入藏的途中连连调伏诸魔：大士来到芒域东拉城，象雄山的山神使魔法用两座大山夹击大士，大士腾身入空中……山神又惊又怕，立即向大士投降，山神从此成为守护伏藏之护法神。大士来到南塘卡尔那，女神放出电光惊雷来阻拦，大士把雷电摄到指尖上，女神胆战心惊跳入巴姆巴塘湖，大士施法把湖水变成滚烫之开水，并挥动金刚杵，击伤了女神的右眼，女神求饶，发愿为大士护一部大的伏藏法。大士来到吾尤哲茂山，有永宁十二尊打出十二道雷电，并移动两山夹挤大士，大士将大山焚烧成木炭，加持之后制伏诸女神，地母从此成为十二尊护法尊，守护一伏藏。大士来到唐古拉山，山神变成一条巨大白蛇挡住去路，大士用木棍插入蛇腰，命它摆好坛城迎接，白蛇不从便逃进雪山，大士融雪为洪水，山岩轰然崩塌，山神苦不堪言，只好恭恭敬敬摆食品坛城，现身为一白衣童子顶礼大士，从此成为伏藏的护法神。大士到狮子岩遇到独生神，它一头伸入大士怀中，随从的无数山神趁机手握兵器猛烈击打大士，大士以五种忿怒相制伏了全部鬼神。此外，大士制伏流传疾病的女鬼，冈底斯山的二十八星神等无数山神鬼魅皆被大士制伏成西藏的佛教护法神。
尤其在建桑耶寺时，大士发出“吽”的咒音召令鬼神众，之后飞升天空，凡大士身影所至处的永宁地母十二尊，雪山崖窟之鬼神、食香、瓶腹鬼、龙王、夜叉、二十八星宿等从各山谷中、河中打捞搬运石土来建寺。开光时，诸佛亲临，寺内有种种瑞相，参加开光盛典的人个个欢喜若狂。
接着为完善西藏的文字语法，选了僧才学梵文和翻译，译师们从印度回来受到藏地宫中苯教徒的诽谤，新生的佛教徒们与他们展开了一场公开大论战，结果取缔了苯波教，从此正式确立了佛教在西藏的地位，树立了正教。
偈中的“格日巴玛斯德吽”是六位大师的名号。“格日”是地狱道南巴尔暖大师，肤色紫红，手持金刚，专救地狱苦；“巴”是饿鬼道的南敕大师，肤色紫黑，手持金刚和钉子，专救饿鬼苦；“玛”是畜生道森燃丹大师，肤色青黑，手持长腰鼓和铃铛，专救畜生苦；“斯”是人类莲花生大士，肤色白红手持金刚和头骨，专救人类生老病死苦；“德”是阿修罗道的南白杰大师，肤色棕灰，手持天杖和头骨，专救阿修罗道战争苦；“吽”是天道的斯土增大师，肤色白黄，手持金刚和铃铛，专救天人死之苦。
此七句颂诵三、七遍而迎请融入后，复行七支供者：
如上明观后，此七句祈祷颂应诵念三遍或七遍不等，而迎请铜色吉祥山莲花光明宫殿一切能依所依真实现前，犹如甘露入于甘露般融入自己即所观的誓言尊者金刚瑜伽母身中。之后，复行七支供者。
二、积资净障
吙！化身尘数恭敬而顶礼
此为调治我慢之顶礼支。吙表示重视之语气，意即：在自己所观想之上师圣众前，明观我的幻化身变成无量微尘数之多，恭敬而如法地顶礼遍满虚空界之无量上师及眷属，同时明观所有三界六道一切众生，同我一起五体投地，祈求灭除一切业障烦恼，积累一切解脱资粮。
如法顶礼之功德无量，以前一位比丘顶礼内装世尊头发与指甲的佛塔，阿难尊者向世尊请问他顶礼的功德，世尊说：“顶礼一次将获得身下所压面积直至金刚地基以上所有微尘数量的转轮王位，然其功德，尚不可尽。”《宝积经》说顶礼可圆满无见顶相的相好！
奉献现有本圆普贤供
此为遣除悭吝之供养支。彼时应观想：一切现有诸法之本性，即是本基净等无二之自性，如是我入定于定解中，奉献现（器世间）有（有情世间）本来圆满之种种供品，即以前面所讲的普贤大乐供云的方式而供养。除陈设自己拥有的实物供品以外，并依等持力之加持，幻化无量殿、轮王七宝、八吉祥徽等无尽妙供，使一切圣境尊众生喜，加持我与众生迅速圆满无量菩提资粮。
无始所积罪堕皆忏悔
此句为净障忏悔支。于忏悔时应具足四力，观想自己无始以来所积累的所有罪堕，即三门所造一切十恶、五无间、近五无间、四重、八邪、掠夺三宝财物等一切罪业，皆化为黑色气团，聚于舌尖上，由上师圣众的身语意放光，照触彼牛簧材羌渲钋嶂刈镆狄徊⑩慊谇寰弧�
轮涅一切诸善作随喜
本句为对治嫉妒之随喜支。其随喜分随喜胜义之功德与随喜世俗之功德二种。即：不论世俗轮回中，凡夫身语意过去、现在、未来所造的一切善业，还是安住胜义涅槃境界的圣者所证二无我的空性，为度众生演说九乘妙法，修持如海菩萨行等，一切诸凡圣所造之善业，我皆作远离嫉妒之无伪随喜。如此诚心诚意随喜的功德，绝对胜过以竞争心对待他人行善或以傲慢心想我也要修此善法等装模作样地行持希求现世名闻、世间八法之毒所充斥的广大善法。《汇集经》中说：“三千须弥可称量，随意善根不可量。”因此说，此随喜法是事半功倍之法，故当随时随地精进行持。
乃至轮尽祈驻金刚身
祈请常转深广正法轮
此二句为对治愚痴之祈请住世、请转法轮支。因佛不住世，成佛不转法轮，则轮回世间犹如一片漆黑，众生不知取舍，极难超脱轮回，故而乃至轮回未尽之前，祈愿上师佛陀留驻金刚身。由于佛、菩萨、上师等一切肩负广大利他重担之士，因众生的邪行及忧劳而生厌烦，不想传法时，应观想自己幻化无数身体，在他们面前供养法轮、右旋海螺等，再三祈请常转深广正法轮，以此不可思议缘起之力，唯愿上师常住世间，广转殊胜妙法轮。
无尽善聚回向成正觉
为使上述所修六支之所有善根不虚耗，成熟果报，并无尽增长故，应修此回向支。回向大致有三类：回向世间圆满；回向自得解脱；回向一切众生成佛。前二种非大乘行者所应取，故应将自他三世所造一切无尽善聚，回向一切众生成就正觉佛陀之果位。
又回向时若有实执，则是有毒回向。而了知能回向者（自己）、回向的善根及所回向的对象（众生等）三者皆空而作回向，则是无毒回向。但此回向对行者的要求甚高，普通人无法实行，此时则思维：上师诸佛如何回向，我亦如是回向。