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1956年，沃森在哈佛大学生物系任教，在那里创建了一个实验室。一代有建树的分子生物学家就是在这里培养出来的。由于发现DNA结构，沃森和克里克及威尔金斯共同获得1962年度诺贝尔医学和生理学奖金。同年，佩鲁兹和肯德鲁获得诺贝尔化学奖金。1968年，沃森离开哈佛转到冷泉港实验室担任指导工作。这是一所规模较小的生物科学研究站，位于长岛北岸。德尔布吕克曾在噬菌体小组筹组期间，将此处选为研究中心。
六十年代中期，分子生物学已逐渐成为一间受到确认的独立学科。这时，沃森决定写一本叫做《发现DNA结构的个人记事》的书。哈佛大学出版社同他签订合同，准备出版他的回忆录。在1966…1967年间，他将初稿送给书中涉及的人员传阅。那时，这本书定名为《诚实的吉姆》。这份初稿遭到了猛烈的批评，但并不是由于作者对某些历史事实记述得不够确切或者作者在自我吹嘘，而是认为作者对很多人的描写没有必要如此尖刻，或者说，有些言论显得简慢无礼。由于这些批评，沃森删去或至少是冲淡了一部分过于触犯人的章节，又补写了一个“尾声”，公开恳请人们纠正那些作者的记忆与他们有出入的地方。作者触犯得最厉害的可能要数罗莎琳德·富兰克林了。但是那时既然她已离开人世，不能再应作者的请求提出什么意见，作者因此同意承认它“对她在学术和个人品德方面的最初印象（书中最初几页曾有记录）常常是错误的”。作者在“尾声”的最后部分，对富兰克林大加赞扬。可以看出，作者在努力纠正书中对她形象所作的含有贬意的描写。但是，正象本书引证1968年2月25日《纽约时报》所说的那样，由于沃森显然没有按批评者的意见把那些过分触犯人的章节作出较为满意的修改，哈佛大学出版社奉命取消了出版该书的合同。这时，书名已改为《双螺旋》了。后来，一家商业出版社——阿森纽（Atheneum）于1968年2月26日出版了这本书。就在出版前不久，《双螺旋》一书曾稍作修改首先在《大西洋月刊》（Atlantic Monthly）一月号和二月号上分期连载，1969年门特书局（Mentor Books）出版了平装本。