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此战战况极其激烈，陈友谅的战舰明显高大得多，而且人数多、声势壮。但是奈何朱元璋手下的二十万兵马都是身经百战的精锐之卒，再加上他调度有方，指挥得法，再出奇谋以火箭覆盖式射向陈友谅的高大战舰，派遣水鬼携带火油投掷到陈友谅的大船上，总之是无所不用其极，最终以微弱的优势惨胜陈友谅，陈友谅只得仓皇逃跑，陈友谅大军全盘溃败。
陈友谅和朱元璋这般大战，早就悄悄的来到了南昌的方国珍怎么可能不去插上一脚呢？他在双方大战了快要分出胜负的时候，果断的命令他带来的三万猛虎军水军从南昌城内杀出，经赣江直奔鄱阳湖，竟然一举擒获了仓皇逃跑的陈友谅以及他的大汉政权的丞相等大部分高官。然而仅仅把陈友谅一行人给逮住了的方国珍并不****，当即带着兵马继续向着鄱阳湖上陈友谅和朱元璋大战的地方行去。
此时硝烟还未完全散尽，朱元璋的士兵大多不是在打扫战场就是在休息吃饭，毕竟连续作战几十日的他们载精神上和体力上都已然远远不济，所以虽然方国珍的人比朱元璋的兵马要少一些，但是此次，方国珍几乎是不费吹灰之力就打得朱元璋仓皇而逃。
见到这样的好机会，方国珍怎么可能错过，所以他一方面传檄后方，让陈仲达等人按照事先的安排出兵攻占陈友谅的城池，一方面自己带着水军去追击朱元璋，而这个时候，早先和方国珍有过约定的扩廓帖木儿已然在出兵攻打朱元璋的老巢应天府（今南京）。
朱元璋带着残余的部队一路顺流而下，想要逃回应天府，而后整顿队伍再来同方国珍较量一番，可是等他到了南京的时候，却赫然发现，城头上已然换了扩廓帖木儿的大旗，当即没差点气得死过去。好在他也不是一般人，眼见着事不可为，当即便向着淮上方向逃跑，打算先逃过此劫以图再起，只是他却没有想到扩廓帖木儿既然都已经把他的应天府给占据了，又岂能不防备他逃跑？所以几乎是毫无悬念的，朱元璋一伙人在奔逃了几日以后，还是被事先就埋伏好了的扩廓帖木儿麾下的兵马给一网成擒。
扩廓帖木儿俘虏了朱元璋一伙，这消息传来，方国珍当真是郁闷极了。毕竟，朱元璋麾下的可不少都是名将之才啊。但是现在，很显然，作为蒙元朝廷的河南王，总统天下兵马的大元帅扩廓帖木儿显然是不会放过朱元璋一伙的。果然，扩廓帖木儿在抓获了朱元璋一伙之后，当即把他们押解进了大都城，最终被元朝皇帝下令斩首于街头。
朱元璋和陈友谅这两大诸侯在短短的时间内便烟消云散了，整个天下格局变成了方国珍和扩廓帖木儿代表的蒙元朝廷的对峙。双方自然是大打出手，由于双方的战线都很长，所以这仗打得时间也长，整整打了五年多，最终，方国珍还是一步步的将扩廓帖木儿逼往北方。毕竟，打持久战显然打的是经济，而腐朽的蒙元朝廷在经济和后勤上怎么及得上作为穿越人士方国珍建立的以农业为根本，鼓励商业发展的新型政府呢？
所以，到了战争后期，扩廓帖木儿的兵马是越打越少，毕竟，蒙古人的总量就那么多，不足百万，而能打仗的精壮男子就更少了，而那些汉军因为蒙元朝廷发不出军饷，俱都消极避战，所以扩廓帖木儿是越打越弱。而方国珍呢，却是死了一个猛虎军却又有千千万万的猛虎军加入进来，是越打越强。此消彼长之下，这场战争的结果是可想而知。最后，双方在大同城外的一场决战，以扩廓帖木儿的战死而宣告了统治了中国九十多年的大元朝彻底终结。
随后，方国珍在南京称帝，建立了大乾王朝。虽然在大同一战，方国珍已经把蒙古军主力完全消灭，但是还是有小股蒙古兵马逃入了滚滚大漠。于是在建国两年后，战争的创伤稍稍恢复以后，方国珍便派遣常遇春等大将出击漠北，一路向着丝绸之路往西往北扫荡而去，而此时，方东海率领的远洋船队也已然在方国珍建立的大型海港吴淞港，隆重起航！（全书完）