由于美国对古巴进行军事骚扰，卡斯特罗立即宣布古巴进入战备状态，并在全国实行军事化。每天早晨，他和劳尔都要检阅部队，准备打仗。与此同时，他在全国开始组建和训练民兵，在“人民拿起武器”的口号下，实行全民皆兵。
美国政府不但在经济上对古巴实行制裁和封锁，还积极谋划推翻卡斯特罗政权，甚至制定了暗杀卡斯特罗的计划，暗杀计划由美国中央情报局实施。1960年3月1日，在美国华盛顿突然传开卡斯特罗被暗杀身亡的消息，这引起了世界新闻媒体格外关注。于是，记者们争相向哈瓦那证实卡斯特罗遭暗杀是否属实。在这种情况下，卡斯特罗通过电话告诉美国记者说：“告诉大家，我说我已死了，所以现在我像一个死去多时的人一样活着……”
在古巴，动荡的局势仍在继续，一些反对和颠覆革命政府的活动时有发生。另外，国内几家有名的电台和报纸继续发表文章攻击政府，其中《前进报》、《海军日报》、《自由媒体》等还刊登了迈阿密和加勒比政治流亡分子的声明，要求选举和结束国内暴力。然而，报社的这种行为，引起了雇员的强烈反对，并决定罢工。卡斯特罗得知后，对此提出说：“他们刊登一切他们想刊登的东西，然后再说这里有新闻检查？这是国际诋毁计划的一部分，目的是为侵略准备条件！”
不过，对那些反革命的叛乱活动，卡斯特罗绝不留情地给予严厉镇压，以确保新古巴政权的巩固和发展。
除此之外，早在1960年1月13日，美国中央情报局局长阿伦·杜勒斯制定了一个代号为“古巴工程”的计划，并提交美国国家安全委员会。该计划虽未提出“迅速消灭卡斯特罗”，但却不排除实施暗杀的可能性。这个行动小组由40人组成，因此叫“40人小组”，是专对付卡斯特罗的。
3月9日，美国中央情报局执行委员会召开会议。在会上，西半球处处长金上校认为古巴政府正准备“一次对关塔那摩海军基地的打击”，要求批准“一举消灭领导人（菲德尔、劳尔和切·格瓦拉）”，否则，“只能以武力推翻”。
3月17日，美国总统艾森豪威尔签署一项命令，并批准推翻卡斯特罗政府的日程。这个针对卡斯特罗的行动纲领主要有四点：在古巴境外建立“有效的、统一的卡斯特罗政权的古巴反对派”；对“卡斯特罗实行强大的宣传攻势”；在古巴国内建立一个“行动和秘密情报组织”，由流亡人员进行协调；在古巴境外“发展准军事力量准备未来的游击行动”。
这时，古巴国内一些脱离甚至叛变了革命的原起义军的成员，急忙跑到乡下，并在山区网罗力量，进行反对卡斯特罗的活动。与此同时，美国中央情报局根据计划，立即在佛罗里达州和尼加拉瓜、危地马拉等国对古巴流亡分子进行军事训练，为日后远征军作准备。
3月底，当卡斯特罗得知美国对古巴流亡分子进行军事训练的情报后，立即对美国政府发出明确的警告：“古巴不是另一个危地马拉。”
危地马拉的革命就是在美国的支持下被镇压下去的，随后在美国操纵下，建立了一个亲美的独裁政府。据古巴“拉丁新闻”通讯社于4月披露的一则消息说：危地马拉总统伊迪戈拉斯同他在尼加拉瓜的同行、独裁者索摩查，已制订了一项反对古巴的密约，而拟定中的入侵古巴的计划已得到美国国务院的支持。
4月25日，古巴政府宣布与危地马拉断绝外交关系，两国的关系由此陷入对峙。
与此同时，美国军方在关塔那摩基地一带发起挑衅行动，借口以扼制古巴军方准备发动的进攻。卡斯特罗立即作出反应，揭露说：“那些说我们将进攻凯马内拉（关塔那摩）海军基地的人……请注意自我侵略，它再也无法骗人……”另外，美国中央情报局的特务，决定将脱毛剂等化学品投入到他生活用具中，以此“永远抹掉他的大胡子”，让他“当众出丑”。同时，败坏他的形象，“影响他行动或改变他的面目”。由此可见，只要能伤害和打击卡斯特罗，美国政府可以采取任何最卑鄙和低劣的手段。这充分说明，美国政府对正在赤化的卡斯特罗憎恨到了不可思议的程度。
5月7日，在这个复杂却又美好的春天里，古巴正式恢复了同苏联的外交关系。随后，卡斯特罗为进一步加强同东方社会主义大国的联系，于是决定派布拉斯·罗加访问中国。在访问期间，罗加受到东方红色巨人毛泽东的热情接见。在友好的会谈中，毛泽东表示支持古巴的革命斗争，尤其是与美帝国主义的斗争。接着，布拉斯·罗加离开中国前往莫斯科访问，并与赫鲁晓夫举行了会谈，取得了令人满意的结果。于是，布拉斯·罗加给卡斯特罗等政府领导发回一封充满喜悦的信。他在信中写道：
与美国新的智斗（2）
“美帝国主义不能在经济上封锁古巴了。我们的工厂不会因缺乏石油而瘫痪，如果美国垄断资本决定削减食糖定额和拒不供应我们日用品，我们的主妇也不会缺少面包。”
这时，古巴移民继续不断地流入美国，其中有企业家、农场主、阴谋家和反革命分子等等。卡斯特罗采取放任自流的政策，而不是堵的政策，让他们涌向美国，因为这样他少了许多潜在的危险和对抗者，但同时也失去了大量的人力资源。这种政策一直持续到20世纪80年代，共有几十万中、上层阶级人士离开了古巴。
6月，美国政府改变了“耐心和克制”的政策，开始疯狂地制裁古巴。22日，国务卿赫脱在参议院请求通过一项更进一步制裁古巴的法案，授权艾森豪威尔削减食糖定额。
6月25日，卡斯特罗迅速作出反应，认为这是美国掀起的一场经济侵略战。于是，他决定当美国的定额每削减一次，古巴政府将没收一家美国糖厂。他对此说：“他们取消了配额，一磅一磅的；我们也取消他们的工厂，一个一个的……”
7月6日，制裁的政策继续深入，美国总统艾森豪威尔把对古巴的定额减去70万吨。他在法案上签字时说：“这一行动等于对卡斯特罗实行经济制裁。现在我们必须考虑其他手段了——经济的、外交的、战略的。”
卡斯特罗立即强烈指责美国经济侵略，并第一次宣布将把武器发放给民兵，准备对付美国随时有可能发动的战略进攻。另外，他还签署了581号法令，决定将美国在古巴的全部财产国有化，其中包括石油提炼厂、36家制糖厂、电话、电力公司和3家著名的银行等。
7月9日，苏共总书记赫鲁晓夫公开宣称：“炮兵”能保卫古巴，必要时可用火箭。同时，苏联还决定承受美国所拒绝的70万吨糖的定额。
8月中旬，虽然美国对古巴进行疯狂的经济侵略，但国际社会给予卡斯特罗政府以很大的同情。因此，在哥斯达黎加的圣约瑟召开的美洲国家外长会议上，赫脱代表美国企图要求会议谴责古巴危害半球，而许多南美代表却表示与此相反的看法。他们认为卡斯特罗在古巴深受人民群众的拥戴，并在人民群众中有很高的威望和号召力。
这次会议并没有达到美国预想的目的，会议只是含沙射影地谴责苏联对古巴的援助，以及批评无产阶级的政权，却没有按美国的意愿对卡斯特罗和古巴进行猛烈谴责。这无疑使美国感到大失所望。
9月2日，卡斯特罗向古巴人民发表激昂的演说。他在演说中豪迈地告诉古巴人民，古巴将接受苏联提供的火箭以击退美国的侵略——反对侵略是对古巴人民具有强烈吸引力的号召。他接着宣布古巴将承认中国共产党。他还指出说：“我们干了什么事以至于应该忍受圣约瑟宣言？我们的人民所做的不过是打破他们的锁链。”
针对国内教会大规模攻击现政府的挑衅行为，卡斯特罗严厉地批评说：“凡是责备我们这种革命的人，就是背弃基督，并且将会再一次地把基督钉上十字架。”
当美国总统大选进入最后阶段时，尼克松对迈阿密的听众说，古巴的新政权是个不能容忍的肿瘤。他还说：“我们怎么办？我们可以做像我们对危地马拉所做的事。”意思是派军队直接入侵古巴。
在这期间，卡斯特罗与苏联签署了一系列协议，其中一些协议为期5年。根据相关协议规定，古巴将购买苏联的各种产品，但主要是石油，价格较美国低33％，而古巴同时每年向苏联提供100万吨糖，售价高于国际市场价格，以保证在此期间7000万美元的贸易顺差。除此之外，古巴还可以从苏联获得大量武器、技术、军事、安全帮助，以及年息25％、偿还期为12年的1亿美贷款。贷款可用集装箱装运古巴生产的水果和各种罐头制品偿还。在宣布这一协议时，卡斯特罗称这是一种“公平交易”。然而，以美国为首的西方国家将这种援助称为“慈父”的援助。
由于苏联全力援助古巴，这引起了美国的十分不满，于是双方的磨擦日益加剧。早在5月1日，美国派最先进的间谍飞机飞入苏联领空时，被苏军迅速击落。赫鲁晓夫称这是对“挑衅古巴的小鬼”的一次有力回击。这起事件发生后，原拟订近期在巴黎举行的美国、英国、法国三国为一方，苏联为另一方的裁军会议告吹。随后，苏方任命阿列克萨耶夫为参赞，作为苏联外交代表常驻古巴，而古巴任命福雷·乔蒙为古巴驻苏大使。接着，民主德国、波兰、捷克斯洛伐克等国，也相继与古巴签署了重要的交流协议。
9月18日，卡斯特罗率代表团乘飞机飞往美国纽约，准备出席第十五届联合国代表大会。到达纽约后，他和随同人员一起住进了谢尔伯恩旅馆。然而，美国联邦调查局和一些警察立即对该旅馆进行监视。在旅馆的周围，聚集了很多反卡斯特罗和革命同情者的人群，这两派之间均发出不同的强烈抗议，并由此引发冲突事件。
由此可见，卡斯特罗在这家旅馆的安全受到严重威胁，这显然是美国政府在背后操纵的。第二天上午，谢尔伯恩旅馆经理以旅馆受到损失为由，强烈要求古巴代表团从旅馆搬走，并且拒绝退还5000美元的消费押金，理由是等候国务院的指示。
在这种情况下，大会未开幕前，卡斯特罗急忙赶到联合国组织大厦，为古巴代表团在美国所受到的侮辱向美国提出抗议。他还在联合国声明说：“如果需要，我们在花园里露宿，这是国际领土。”
与美国新的智斗（3）
然而，美国中央情报局确实想利用这次千载难逢的好机会干掉卡斯特罗。美国特工人员企图将炸药和毒杆菌放进卡斯特罗爱抽的雪茄烟中，以此结束这个被美国政府痛恨的对手，但均没有得逞。
这时，哈雷黑人运动负责人向卡斯特罗介绍了本区一个叫特丽萨的旅馆，该旅馆位于125街与第7街街角之间。当卡斯特罗率古巴代表团来到特丽萨旅馆时，立即受到几千名黑人的热烈欢迎。但是，当美国政府在沃德夫阿斯托里亚举行盛大宴会时，他没有被邀请参加。他是在旅馆经理、服务人员及采访记者的陪同下吃了午餐。
在特丽萨旅馆，先后来拜访卡斯特罗的有赫鲁晓夫、铁托元帅和埃及总统纳赛尔。这是他第一次见到苏共领导人赫鲁晓夫，