2002年2月，普京根据卡西亚诺夫总理的提议，解除克列巴诺夫的副总理职务，此前他主管的交通部、核能部、通讯与信息部改由总理直接负责。舆论认为，克列巴诺夫被解职是俄罗斯政府通过改组提高效能的结果。
2002年8月12日，普京签署总统令，具有过渡性质的《国家公务员公务行为准则》开始实施。与此同时，2002年底俄政府准备向国家杜马提交有关行政改革的一揽子法律文本，届时俄现行的国家管理体制将有巨大变化。其中包括修改一些框架性的、原则性的法律，并考虑废除1995年通过的《俄联邦国家公务员基础法》，代之以俄联邦国家公务员体系等。
与“寡头”作战（一）
2000年6月13日，俄罗斯总检察院以诈骗和盗窃罪将号称俄传媒“龙头老大”、俄金融“七巨头”之一的古辛斯基拘捕。证据是，1996年底古辛斯基的“大桥”集团在购买国家电视公司“圣彼得堡第十一频道”70％股份的时候只花了25万旧卢布，而该频道的实际价值高达1000万美元。合同签署12天后，该频道的负责人在芬兰的个人账户上就出现了100万美元的好处费，这笔钱的曝光使俄罗斯检察机关认定古辛斯基在其它地方有类似的侵吞国家财产的犯罪行为。被捕后的古辛斯基立即被押往莫斯科条件最恶劣的布德尔卡监狱。此事在俄政坛立即引起轩然大波。紧随其后，数名金融寡头连遭传讯，一场普京和俄金融寡头的殊死争斗由此拉开帷幕。
众所周知，经济转轨以来，在俄罗斯的经济生活中，出现了金融资本与工业资本相互渗透、不断融合的金融集团，他们中的一些“精英”已经不满足于当大款，他们开始企图控制国家政权，这些人被称为“寡头”。
1996年初，叶利钦总统的第一任期即将结束，国内竞选斗争日趋激烈。古辛斯基等寡头非常担心俄共领导人久加诺夫获胜。同年3月，以别列佐夫斯基和古辛斯基为首的企业巨头达成谅解，成立了知名企业家小组，出资全力支持叶利钦再次参加总统大选。
鉴于“寡头”对叶利钦的资助，在叶利钦执政期间，寡头们的日子过得十分滋润。其代表人物别列佐夫斯基就是一个例子，此人长脸、秃顶，有点儿口吃，他不仅家财万贯，还利用与叶利钦的特殊关系左右了俄政策。
对寡头们来说，没有什么做不成的事。还以别列佐夫斯基为例，从无执政经验的他，硬是一步就坐到了国家安全会议副秘书的位子上。其后，叶利钦说服独联体12个国家元首，他转眼间又成了独联体执行秘书，在独联体内飞来飞去，与大小总统们讨论着独联体的未来。
1998年3月至1999年5月俄政府的三次更迭都与金融寡头的幕后操纵有关。别列佐夫斯基在普京当选为总统后还自豪地对外宣称，自己“在宣布普京为叶利钦接班人和总理人选等问题上，发挥了极其重要的作用”。并夸口说：“几乎所有的政治家都有自己的身价，他们差不多都被我收买了。”
同时这些寡头控制的经济部门也越来越多。据别列佐夫斯基估计，包括俄罗斯“七巨头”在内的金融工业集团已控制了俄罗斯经济的近50％。
《环球时报》曾报道，俄罗斯寡头新贵的穷奢极侈，同平民百姓的贫苦形成了巨大反差。例如遭到通辑的俄寡头古辛斯基，经常身着豪服出入巴黎五星级饭店，每餐一掷千金。他的周末是在欧洲的私人别墅里度过的，在西班牙和伦敦的奢华场所经常能看到他的身影。古辛斯基出门必有保镖跟随。他周末打网球时，在网球场巡逻的武装警卫多达15人。古辛斯基公开声称，他雇佣的保安人员达几千人之多。
而另一方面，俄罗斯近两成居民处于赤贫状态。在俄大城市的地下通道里，总能见到骨瘦如柴的老妪，伸着颤抖的手，眼泪汪汪地向行人乞讨。每当傍晚，街头就会出现一些老妪，手中举着几条干鱼、几根香肠或几包油炸马铃薯片，她们从不叫卖，只是默默地呆立着，眼巴巴地望着过往行人，静候问津者。更凄惨的景象是有的老年寡妇，手中居然举着年轻时获得的劳动勋章，或是卫国战争中牺牲的亡夫的衣服，期待着能换回点食品。这种鲜明的对照，令有良心的俄罗斯人都感到痛心疾首。
面对这种情况普京发誓要“让人民过上好日子”。他强调说：“我们的优先方向是保护市场，使其免受达官显贵和犯罪分子的非法侵入”，“所有经营主体应该一律平等”，同寡头的关系应“像同小面包房主和修鞋店主一样”，“诚实的工作应该比偷窃得到更大的收益”。普京还坚定地表示，政府惩治金融寡头的行动“今后再也不会回头”！
寡头们原以为“普京之所以说要摆脱寡头，是因为他必须这样对选民说……但要摆脱寡头是不可能的”。的确，前俄总理普里马科夫也曾努力打击金融寡头，结果却被叶利钦和金融寡头搞下了台。普京被认为是“忠于叶利钦的人”，何况金融寡头还大撒金钱支持过他竞选。
但寡头们这次却失算了，普京就算原来曾经忠于过叶利钦，但看到改革失败给俄罗斯造成的灾难后，他也未必愿意违背自己的良心，继续推行叶利钦已经失败的政策。据报道，叶利钦曾向报刊发表评论，公开为金融寡头进行辩护，指责普京打击惩治他们的行动。但是，据一项社会舆论调查，大多数民众认为叶利钦过大于功，被评为“最差的、最黑心的”领导人之一。普京显然不愿意继续追随叶利钦，为了维护少数金融寡头的利益，重蹈其身败名裂的覆辙。
因此普京上任后采取了完全的另一种态度：与寡头们划清界限。那个克里姆林宫以前的常客别列佐夫斯基，因此感觉到了从没有过的失落。他虽然是国家杜马的代表，但在议会里没有自己的党派，说话也没人听，于是便主动放弃议员资格，成了地地道道的反对派。在普京提出在联邦内加强上下垂直领导的建议后，他迫不及待地跳出来，又是发表言论，又是给普京写公开信，声称普京的政策将导致俄罗斯分裂。但普京并没有理会他的“热心建议”，别列佐夫斯基自讨没趣。
此次反寡行动先拿古辛斯基开刀，主要是普京想告诫那些处处跟政权过不去的大小政客好自为之。古辛斯基是俄罗斯媒体大亨、“大桥媒体集团公司”的老板。该集团控制着俄罗斯颇有影响的独立电视台、“莫斯科回声”电台、《今日报》和《总结》周刊。在1999年的国家杜马选举和2000年的总统选举时，一向精明过人的古氏却看错了方向，把宝押在了与叶利钦积怨颇深且雄心勃勃要接管叶氏政权的普里马科夫—卢日科夫竞选联盟上。其时，该集团利用手中控制的数家媒体，历数叶利钦总统执政十年来的种种失误。一时间，叶氏及其“家族政治局”的声望扫地，陷入十分被动的局面。
与“寡头”作战（二）
在普京任代总统期间，俄国内政局日趋稳定，经济持续增长，普京的支持率居高不下。然而此时古辛斯基依旧站在反对立场上，利用自己控制的媒体向当局发动了猛烈攻击，指责俄最高当局在车臣等问题上的政策，在报道车臣战争时经常突出消极面，暴露当局的失误。1999年在莫斯科等地连续发生了数起恐怖爆炸案件，居然有传闻说俄特工部门参与了这些爆炸事件，古氏手下的媒体于是对此进行大肆渲染，使得这种说法被西方利用，用以攻击俄当局，使俄在车臣问题上陷入被动局面，普京总统对此极为恼火。
在叶利钦指定普京作为权力继承人、担任政府总理并参加总统选举后，古辛斯基又不失时机地利用手中控制的媒体，对普京发动的围剿车臣非法武装的反恐怖行动大肆暴露阴暗面，百般责难强力部门无能，践踏人权，滥杀无辜；甚至在总统竞选期间利用电视披露普京在彼得堡市政府工作时所谓的金融违法行为等，让普京丢丑丢分。
当普京成为总统后，与普京针锋相对的莫斯科市长卢日科夫很快改变了斗争策略，政治锋芒有所收敛，且不断与普京改善关系。但古辛斯基仍顽固不化地继续与克里姆林宫唱反调。他频频利用手中的媒体对普京改革国家权力机构的措施大肆攻击，指责他加紧“复辟专制制度”，“压制言论自由”，并跑到西方国家游说西方媒体对俄采取的各项内政外交政策施压，使总统普京难堪。
因此，普京这一次把古辛斯基作为首选打击对象，通过手中掌握的大量证据让检察机关追究“大桥媒体集团公司”的金融诈骗行为。
据古辛斯基执掌的“大桥”集团公司人士透露，其实早在1999年春天，总统办公厅就曾向古辛斯基施压，迫其移居国外。总统办公厅主任沃洛申在时任总理斯捷帕申的办公室里半开玩笑半认真地对古辛斯基说，“让我们替你偿还外经银行和其他借贷者的欠款，再给你1亿美元，条件是你在总统大选前必须移居国外。”但古辛斯基未予理睬。总统大选期间，俄上层又向“大桥”集团施压，要求其偿还4600万美元的贷款。2000年3月，俄上层权力机关走廊里开始风传要把独立电视台从“大桥”集团分离出去。5月11日，俄执法部门强行搜查了“大桥”集团的几间办公室。5月17日，俄中央银行在“大桥”银行掺沙子，任命了临时负责人。此后不足一个月，古辛斯基就身陷囹圄。6月16日，蹲了三天大牢的古氏被取保候审，假释出狱。此后，古辛斯基隔三差五就得去总检察院受审。在古辛斯基被捕的同时，其他“寡头”也受到了普京的打击。
6月20日，莫斯科市检察院上诉仲裁法庭，要求重新审核俄国际集团公司1997年收购诺里尔斯克镍公司38％股份的合法性。
俄国际集团公司总裁波塔宁（七巨头之一）于1997年出资17亿美元收购了诺里尔斯克镍公司。这是世界上第二大产镍企业。据估计，该公司实际价值应为31亿美元，收购价格差额竟高达14亿美元。
人们认为，波塔宁因1996年斥巨资支持叶利钦竞选总统有功，作为回报，波塔宁被叶氏任命为政府第一副总理。有人揭发说，波塔宁当时利用手中权力，达成了这笔交易。俄总检察院要求波塔宁退还其侵吞的14亿美元。据报道，由于受诉讼影响，该公司上市股票急剧下跌，仅此一项，公司就损失15亿美元。
6月27日，“阿尔法”集团下属的秋明石油公司被搜查。该公司1997年至2000年的所有文件被强行搜走。据初步调查，该公司与金融诈骗有关。
7月11日，俄总检察院强行“调阅”俄石油天然气工业公司文件，说要调查古辛斯基的“大桥”集团欠俄石油天然气工业公司487亿美元债务一事。知情人透露，这与该公司领导人维亚希列夫在古辛斯基被捕后和其他寡头联名上书俄总统，公开为古辛斯基鸣冤叫屈有关。
7月12日，俄税务警察局对伏尔加汽车公司逃税案进行了调查。该公司1999年年产“拉达”轿车65万辆。税方指控该公司虚报年产量为20万辆，从而大量逃税。该公司负责人卡丹尼科夫立即举行记者招待会，申辩自己的清白无辜。伏尔加汽车公司的后台老板就是在叶利钦时代呼风唤雨的俄首富、头号金融和工业寡头别列佐夫斯基。
7月19日，联邦总检察院又宣布查封古辛斯基的财产，但后因“