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新朝开基，百废待兴。然而眼下第一位的还是战争。陈友定未平，两广未下，巴蜀割据，特别是元朝皇帝还安坐在大都。
汤和攻下福州，派遣使者到延平劝降。陈友定置酒宴请诸将及宾客，杀了使者，将他的血沥进酒坛，与大家共饮，而后慷慨誓师：“我们大家十几年生死与共，受到国家的厚恩，目下只能以死相拼。谁要是不以死相抗，我分他的尸，杀他的全家。”汤和于是急围延平。延平人心浮动，军士解体，有不少人偷偷越城投降。十几天以后，洪武元年（1368）正月二十九日，忽然城中军仗库起火，火药爆炸声如雷鸣，汤和乘乱攻城，一举克复，陈友定饮毒药而死。汤和的部队搜索到陈友定，尚有一口余气，终于把他救活。此时陈友定的儿子从外地投延平，愿同父亲一起去死。汤和将他们父子送往京城。元璋历数他杀胡深、杀使者之罪，陈友定毫无求饶之意，厉声说道：“死就是了，何必多言。”他父子同时被杀。此时，胡美、何文辉西路军也顺利攻下建宁路。兴化、漳州、泉州诸路都闻风而降，福建全境在洪武元年年初全部平定。
洪武元年（1368）二月初二，调汤和提督海运，在宁波造海船运送江浙的粮食输往直沽，以保障北伐军的供应，同时任命廖永忠为征南将军，浙江行省参政朱亮祖为副将军，由海道取广东。
第五章 皇帝轮流做，今儿到我家放牛娃衮冕正大位，元顺帝车驾没黄沙（2）
元璋面授攻取方略：“朕当年平定了武昌，荆、襄诸郡望风款附；常遇春克赣州，南安、岭南数郡也相继来归。就是因为威重势至，军纪严整，人心悦服。现在两广之地，彼此割据，百姓穷困。他们听到八闽不守，湖、湘已平，必然人心震慑。如果先遣人宣布朝廷威德，一定有归款迎降的。不得已而举兵，则要扼其险要，绝其声援，使他们彼此隔绝。广东的要害在广州，广州既下，沿海州县可以传檄而定。海南海北，依次招降，要留足够兵力镇守，防其反复。然后派兵与杨璟合兵，共取广西。”二月二十一日，又令赣州卫指挥使陆仲亨率师南下会同廖永忠攻打广东，告谕他：“近命杨璟由湖南取广西，廖永忠由福建取广东，尔等则自韶州直捣德庆，三方进兵，互为犄角，必无不克。广东既下，合兵取广西，将成破竹之势。重要的是严肃军纪，安抚百姓，毋杀毋掠。”
这时候，盘踞广州等郡县的是地方割据势力何真。何真，字邦佐，广东东莞人。原为河源县小吏，元末兵乱，何真聚兵自保，协助元地方政府平叛，以功授惠州路同知，江西行省广东分省左丞，势力及于广东诸郡县，是与元朝有朝贡关系的地方军阀。廖永忠依据元璋的指示，对何真下书劝降，同时自福州航海至潮州。何真派都事刘克庄赶到潮州，奉上印章并所属郡县户口兵粮数目，奉表请降。永忠奏报朝廷，元璋十分高兴，对何真下诏褒奖，把他比作河西五部大将军窦融归附汉光武帝，瓦岗寨首领李■（徐懋公）归附唐高祖。谓：“朕惟古之豪杰，保境安民，以待有德。若窦融、李■拥兵据险，角立群雄间，非真主不屈。尔何真连数郡之众，乃不烦一兵，保境来归，虽汉唐名臣奚让焉。今特驿召来庭，赐尔名爵，以彰有德。”廖永忠师抵东莞，何真率官属迎接慰问。广东政权实现了和平过渡。何真奉诏入京，被升擢江西行省参政，后封东莞伯，得善终。
洪武元年（1368）正月，杨璟、周德兴南征军围宝庆、永州。二月，克宝庆、全州、宁远及桂阻路蓝山县。四月十七日，困疲不堪的永州城被攻陷。遂挥师围困静江路（桂林），以左丞周德兴扼守险要，阻断各路增援。此时征南将军廖永忠、副将军朱亮祖的部队已从广州沿江西上，克梧州、郁林、藤州，会师静江，屯扎象鼻山下。形成对静江路的四面包围。城中坚守两个多月被攻破。随后，廖永忠、朱亮祖定南宁、象州，杨璟定郴州等地。到洪武元年（1368）七月，广西全境平定。
吴元年（1367）十二月初北伐大军克济南，平济宁，稍作休整。元璋的主要精力也放在即位登基。开国大典的兴奋与忙碌一过，北伐再往前推进。
明洪武元年（1368）正月二十九日，元璋派一向经营荆襄待时而动的邓愈为征戍将军率部北上南阳，攻略河南。二月初，征虏副将军常遇春自济南西取东昌。随即元璋又派出康茂才率师抵达济南。大军北攻乐安。元璋遣人向徐达下达指令：“如乐安半月可下，则率师自黄河南下河南，取汴梁。否则，留精锐亲军作围困之计。都督同知康茂才、张兴祖，右丞薜显、参政傅友德所统诸将士由都督冯胜节制向济宁草桥集中，听候调发。”徐达于二月二十四日接到指令，第二天就攻克乐安，拔掉山东最后一个钉子，山东全境大体平定。三月十六日，大军汇集济宁，直取汴梁。军至陈桥，汴梁守将李克彝命自安丰来投的左君弼迎战，左君弼感戴朱元璋曾将他的母亲礼送汴梁，拒不出战，李克彝弃城逃窜，左君弼与元将竹昌以城降。徐达西出河南府（洛阳市）。元将脱因帖木儿等以五万之众迎战。战斗打得相当激烈，但元军毕竟士气消沉，人心惶惧，终至溃散退走。河南行省平章梁王阿鲁温率众投降。而后郑州、荥阳、嵩州、钧州、汝州相继而下，冯胜率师直抵陕州，逼进陕西。洪武元年四月二十四日元璋遣使告谕都督同知冯胜：“如果拿下潼关，且勿急于求胜西进。现在主攻在北方，宜选将留兵守关，遏其援兵东进。尔即率师回汴梁。朕将亲自去汴梁议事。”冯胜斩将夺关，李思齐、张思道弃关西走，冯胜追至华州而止。
五月二十一日，元璋的车驾到达汴梁，考察地势民情，慰问将士。而后同徐达讨论北征方略，并首先征求徐达的意见。徐达说：“臣自从平齐鲁，下河洛，王保保便在太原拥兵自守，犹豫观望。现在潼关又为我有，张思道、李思齐失势西窜。则是元朝的声援已绝，陛下第一步战略构想已经实现。臣等乘势捣其孤城，必能顺利克复。”元璋大体同意徐达的想法，但提醒他两件事：一、北方地势平旷，利于骑战，要选好精锐骑兵。二、北方遍地荒凉，粮饷供应加意筹备。徐达请示：“如果大都克复，元主向北逃窜，是否穷追？”元璋告诉他：“元运已衰，行将自灭，不必穷追。你但固守封疆，防止它的侵扰就可以了。”元璋知道，要防止元朝骑兵逃逸是不可能的，而眼下也还不是塞外逐剿的时机。
粮饷准备已足，运船齐集济宁，扬帆北上。河南的各路部队已在汴梁陈桥集结待命，七月十一日，元璋又命徐州、济宁、益都驻军会师东昌。同时派康茂才自陕州渡黄河，入山西，牵制王保保（扩廓帖木儿）。七月二十三日，元璋离开汴梁回应天，临行，告诫徐达：“中原之民，久为群雄所苦，死亡流离遍于道路。前代革命之际，兵革相加，肆行屠戮，违天虐民，朕实不忍，尔诸将帅当以为戒。克城之日，毋掳掠，毋焚荡，毋妄杀人。要做到市不易肆，民安其业。凡元朝的宗戚，都要妥善对待，加以保护，以成朕伐罪救民之志。有不听命者，罚无赦。”
闰七月初二，徐达率军自汴梁北上。根据元璋授予的进军图，一路经卫辉、彰德、邯郸，几乎是一帆风顺。然后折而东向，抵达临清。遂传檄东昌部队、乐安驻军在临清会师。七月十五日，自临清数路推进，沿德州、沧州、清州一线北上，七月二十三日，攻克直沽，元丞相也速等望风逃遁，大都惶恐。在河西务和通州经过激烈战斗，闰七月二十八日占领通州，逼近大都城下。元顺帝召集后妃、皇太子布置弃京北行。诏淮王帖木儿不花监国，与中书左丞相庆童同守京城。二十八日夜，元顺帝率后妃皇太子等卉建德门出居庸关北遁。蒙元王朝，发祥在大漠以北，入主中原以后，比较顽强地保持了蒙古固有文化，因而很难建立中原地区长久而稳固的统治，但是大漠南北的广阔天地却成为它退避斡旋之地。元顺帝率宫妃仓皇宵遁，直奔上都而去，也就不像历代亡国之君，被逼向绝路。然而，一路风声鹤唳，一路黄沙飞尘，几十年的大都繁华已成梦境，眼下如受伤的野兔，落荒而逃，元顺帝不禁潸然泪下。
明洪武元年，元至正二十八年（1368）八月初二，攻克大都。徐达登上齐化门，宣布监国淮王帖木儿不花、中书左丞相庆童数人的罪状，斩首。其余未妄杀一人。他派人查封府库宝物、图籍档案，封锁元宫殿各门，令指挥张焕率千人把守，宫人、嫔妃、公主则着令宦官看护，严禁将士接近。街肆百姓秩序井然，充分显示了元璋军令的森严和徐达治军的严格。至此，宣告元朝灭亡。
八月十五日，命大将军徐达、副将军常遇春、右副将军冯胜、偏将军汤和、平章杨璟统率大军西取山西。
徐达派副将常遇春率军南下取保定、真定，自娘子关西进，而另派冯胜、汤和自河南路（洛阳）渡黄河取怀庆，自南向北攻取泽州、潞州。十一月中旬，扩廓帖木儿奉元主自开平发出的指令，从太原出雁门经居庸关进攻北平（明朝改元大都为北平府）。徐达对将领们说：“王保保大军远出，太原必然空虚。孙兴祖都督以六卫之师镇守北平，足以抵御。我军当乘其不备，直捣太原，此兵法所谓‘批亢■虚’者也。彼若西还自救，亦必自投罗网。”乃引兵直趋太原。扩廓师至怀来，得到太原告急的消息，果然掉头自救，回防太原。喘息未定，他的部将豁鼻马早已与明军暗通声气。十二月初一日夜，城内突然燃起大火，四门大开，常遇春率部鼓噪而进。这时扩廓正在灯下书写防城手令，见部众自相惊溃，慌乱间拖了一只鞋，乘一匹弱马，率十八个亲卫骑兵夺路逃走。豁鼻马以四万余众归降。常遇春率轻骑追击到忻州，扩廓西走甘肃，山西一举平定。
第五章 皇帝轮流做，今儿到我家放牛娃衮冕正大位，元顺帝车驾没黄沙（3）
洪武二年（1369）三月，大军渡黄河，入陕西，克西安，进凤翔。李思齐远奔临洮，张思道据守庆阳。徐达因庆阳城险兵精，攻拔比较困难，而且溃败西走，易与临洮呼应会合，便稳而不打，而